RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	DOG1	P38774	246 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SER33	P40510	469 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	AGX1	P43567	385 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MRX5	P47007	382 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	TAD2	P47058	250 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	TIM21	P53220	239 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MAL12	P53341	584 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	ARP5	P53946	755 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	VBA1	Q04301	562 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	PEX12	Q04370	399 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	ERV41	Q04651	352 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	BOP2	Q06150	570 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	LOA1	Q06508	300 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	PST1	Q12355	444 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YPL247C	Q12523	523 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YOS9	Q99220	542 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	COS2	P0CX12	379 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	COS3	P0CX13	379 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YCR102C	P25608	368 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SHC1	P39000	512 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YJL118W	P47022	219 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YJL028W	P47062	111 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YGL185C	P53100	379 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	ATC1	Q04005	294 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SLD7	Q08457	257 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	GEP5	Q12393	293 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	CDC7	P06243	507 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	PUT1	P09368	476 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	POX1	P13711	748 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	POF1	P25576	258 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	CWP1	P28319	239 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MRPL40	P36534	297 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.8	□□□□□ -2.28	not detected
YJL135W	YJL135W	PRM9	P39551	298 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MDM34	P53083	459 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SPP2	Q02521	185 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	PEX10	Q05568	337 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	ARV1	Q06541	321 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	CTR3	Q06686	241 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YLR413W	Q06689	675 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SAS5	Q99314	248 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	STH1	P32597	1359 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	DAL80	P26343	269 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	HSM3	P38348	480 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YHL049C	P38722	271 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	RCY1	P39531	840 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	PEP8	P40335	379 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	FMP33	P46998	180 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	NBP35	P52920	328 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	LSB1	P53281	241 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MNT4	P53745	580 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	AAH1	P53909	347 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SWS2	P53937	143 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	EMI1	Q04406	187 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	FMP16	Q12497	93 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	DOA4	P32571	926 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YKL070W	P36087	169 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	ECM13	P38195	257 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	PEX18	P38855	283 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SNX4	P47057	423 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	CDC14	Q00684	551 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	INM2	Q05533	292 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	YPR011C	Q12251	326 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	MHT1	Q12525	324 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YJL135W	YJL135W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	COA1	P40452	197 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	OST2	P46964	130 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YJR012C	P47087	207 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MAL13	P53338	473 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	PRM15	Q03262	622 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	GMC2	Q06201	188 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	SGA1	P08019	549 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	RCN1	P36054	211 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	DDI1	P40087	428 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	RSM10	Q03201	203 aa		0.76	□□□□□ -2.29

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