RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAD51CO43502 376 aa17.6■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LPXNO60711 386 aa17.6■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R37O75864 691 aa17.6■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DGAT1O75907 488 aa17.6■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT7P08729 469 aa17.6■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRLF3Q8IUI8 442 aa17.6■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDZD8Q8NEN9 1154 aa17.6■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPA1O75762 1119 aa17.6■□□□□ 0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.6■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa17.6■□□□□ 0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VCX3AQ9NNX9 186 aa17.59■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBX3O15119 743 aa17.59■□□□□ 0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa17.59■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEAK1Q9H792 1746 aa17.59■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETSIPP0DME0 302 aa17.59■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT3P12035 628 aa17.59■□□□□ 0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MX2P20592 715 aa17.59■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPHB1P54762 984 aa17.59■□□□□ 0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATG16L1Q676U5 607 aa17.59■□□□□ 0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa17.58■□□□□ 0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COMTP21964 271 aa17.58■□□□□ 0.4
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2CD6Q53TS8 623 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAAF5Q86Y56 855 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF710Q8N1W2 664 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO41Q8TF61 875 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMYD3Q9H7B4 428 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PARVAQ9NVD7 372 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC36A6NLP5 189 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRAP2O75791 330 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAV1Q03135 178 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCOA4Q13772 614 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BEST2Q8NFU1 509 aa17.58■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNKPQ96T60 521 aa17.58■□□□□ 0.4
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