RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424658.5

ARID4A-205, Transcript of AT-rich interaction domain 4A, human

TSL 2

Gene ARID4A, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID4A-205	ENST00000424658	TUSC3	Q13454	348 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	PTGES	O14684	152 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	CREM	Q03060	361 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	PPP2R5A	Q15172	486 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	ECM1	Q16610	540 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	LILRA6	Q6PI73	481 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	B3GALT6	Q96L58	329 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	TRIP11	Q15643	1979 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	EDN1	P05305	212 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	PRKCB	P05771	671 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	TDG	Q13569	410 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	PDIA5	Q14554	519 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	NAB2	Q15742	525 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	KCNK12	Q9HB15	430 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	SNTG2	Q9NY99	539 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ARID4A-205	ENST00000424658	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	27.58	■■■□□ 2.01	8e-6	■■■■■ 107
ARID4A-205	ENST00000424658	VWA8	A3KMH1	1905 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	TGM5	O43548	720 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	TADA2A	O75478	443 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	RFPL2	O75678	378 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		27.57	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	RECQL4	O94761	1208 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	TH	P07101	528 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	EFNA5	P52803	228 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	RABGGTA	Q92696	567 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	STAM	Q92783	540 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	KIFAP3	Q92845	792 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	CLUH	O75153	1309 aa		27.56	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	CLCN5	P51795	746 aa		27.55	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	RTP2	Q5QGT7	225 aa		27.55	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	PALB2	Q86YC2	1186 aa		27.55	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		27.55	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	KIF4A	O95239	1232 aa		27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	NBR1	Q14596	966 aa		27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	IFT74	Q96LB3	600 aa		27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		27.54	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		27.53	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		27.53	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	SPATA31D3	P0C874	917 aa		27.53	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		27.53	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		27.53	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		27.53	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	USP20	Q9Y2K6	914 aa		27.53	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	LAD1	O00515	517 aa		27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	PTGDR	Q13258	359 aa		27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	NXPE3	Q969Y0	559 aa		27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	RAB34	Q9BZG1	259 aa		27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		27.52	■■■□□ 2
ARID4A-205	ENST00000424658	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ARID4A-205	ENST00000424658	ZMYND10	O75800	440 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ARID4A-205	ENST00000424658	C8orf34	Q49A92	452 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ARID4A-205	ENST00000424658	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
ARID4A-205	ENST00000424658	MYADM	Q96S97	322 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ARID4A-205	ENST00000424658	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ARID4A-205	ENST00000424658	MYB	P10242	640 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ARID4A-205	ENST00000424658	NPR3	P17342	541 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ARID4A-205	ENST00000424658	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
ARID4A-205	ENST00000424658	PRPH	P41219	470 aa		27.5	■■□□□ 1.99

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