RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARVCFO00192 962 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPP6CO00743 305 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 LATS1O95835 1130 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAAP10253 952 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 MPGP29372 298 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRIA3P42263 894 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 FNTBP49356 437 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 RACK1P63244 317 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 GUCY1A3Q02108 690 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 FXNQ16595 210 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM119Q4V9L6 283 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNNI3KQ59H18 835 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC38Q5R3I4 469 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 KAZNQ674X7 775 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 COLGALT2Q8IYK4 626 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 LNX2Q8N448 690 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEC16BQ96JE7 1060 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 PADI4Q9UM07 663 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAF6Q9Y4K3 522 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC12A8A0AV02 714 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 TBKBP1A7MCY6 615 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALPLP05186 524 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLEC2LP0C7M8 214 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 CXADRP78310 365 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 APBA1Q02410 837 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 TFF2Q03403 129 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRC41Q15345 812 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPY5RQ15761 445 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 NBPF8Q3BBV2 869 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 METRNLQ641Q3 311 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 OSBP2Q969R2 916 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 SH2D3AQ9BRG2 576 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIPK2Q9H2X6 1198 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC3P53804 2025 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELANEP08246 267 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 RHDQ02161 417 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 UBE3CQ15386 1083 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC2A7Q6PXP3 512 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMPRSS12Q86WS5 348 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNF169Q8NCN4 708 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIST1H2AJQ99878 128 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL11Q9NVR0 708 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 MPPED1O15442 326 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 T-ENOLP0DO92 83 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHN2P52757 468 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAPK10P53779 464 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 FANCCQ00597 558 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TWIST1Q15672 202 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIAA0895LQ68EN5 471 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTPRN2Q92932 1015 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHACTR3Q96KR7 559 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 NEU1Q99519 415 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIM55Q9BYV6 548 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNPEPQ9H4A4 650 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCNE5Q9UJ90 142 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A0A6YYJ9 748 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAV20A0A0B4J274 112 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 YY2O15391 372 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 EYA4O95677 639 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TUBB4AP04350 444 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYP2D6P10635 497 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 SREBF1P36956 1147 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 C9orf50Q5SZB4 431 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSHZ3Q63HK5 1081 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 FOXR2Q6PJQ5 311 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 PIK3C3Q8NEB9 887 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 HAPLN3Q96S86 360 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARID3AQ99856 593 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRSS22Q9GZN4 317 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1B0GTW7 788 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 DRGXA6NNA5 263 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCNU1A8MYU2 1149 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM191BP0C7N4 346 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 HTR6P50406 440 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 VAV2P52735 878 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 IRF9Q00978 393 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKS6Q68DC2 871 aa2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms