RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W RPC53P25441 422 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W PUP2P32379 260 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W RNP1P32385 249 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W MCH2P36032 473 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YPC1P38298 316 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W ERV15P38312 142 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W CAJ1P39101 391 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W PRP39P39682 629 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W RIO2P40160 425 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YMR134WP40207 237 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W SOK1P40317 901 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YKE4P40544 346 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W NIF3P53081 288 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W RMT2Q03305 412 aa-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W COS2P0CX12 379 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W COS3P0CX13 379 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YHR212W-AP0CX91 67 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W THR4P16120 514 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W FUR1P18562 216 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W OAC1P32332 324 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W HMX1P32339 317 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W AEP1P32493 518 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W VPH1P32563 840 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W HMT1P38074 348 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W CTR2P38865 189 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W OST2P46964 130 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YJL028WP47062 111 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W TAF6P53040 516 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YGR219WP53307 113 aa-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W FMP41P53889 259 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W Q0255P03881 472 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W RAD3P06839 778 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W UGA1P17649 471 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W FAA1P30624 700 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W MAL32P38158 584 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YHR035WP38769 630 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W TEM1P38987 245 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W UBC13P52490 153 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W MAL12P53341 584 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W DBP6P53734 629 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YNR068CP53754 272 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W IRC4Q03036 179 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W LOA1Q06508 300 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W TAZ1Q06510 381 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YFH1Q07540 174 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W MSA1Q08471 629 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W YPL162CQ12042 273 aa-0.59□□□□□ -2.5
RDS3YPR094W HSP82P02829 709 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W CDC31P06704 161 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YLL053CP0CD98 152 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W ACB1P31787 87 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W UGX2P32772 223 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W UIP5P36137 443 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YHI9P38765 294 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RCY1P39531 840 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W GDS1P41913 522 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W AGX1P43567 385 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.6□□□□□ -2.51not detected
RDS3YPR094W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W EMI1Q04406 187 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W BOP2Q06150 570 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W AKR2Q12013 749 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W USB1Q12208 290 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W PST1Q12355 444 aa-0.6□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W PET9P18239 318 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W VMA5P31412 392 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W ZRT1P32804 376 aa-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W SVP26P38869 228 aa-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W MLC1P53141 149 aa-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YML018CQ03730 393 aa-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W DPP1Q05521 289 aa-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W NFI1Q12216 726 aa-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YOR114WQ12219 294 aa-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YPR1Q12458 312 aa-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa-0.61□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RPN12P32496 274 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W SRY1P36007 326 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W ECM13P38195 257 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W SSH1P38353 490 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W BIG1P38813 335 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YHR180WP38868 163 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W ALP1P38971 573 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YIL001WP40560 513 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W TOS8P53147 276 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YGR016WP53209 190 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W SDC1Q03323 175 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W SPO24Q3E752 67 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RGS2Q99188 309 aa-0.62□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RPC40P07703 335 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W FZF1P32805 299 aa-0.63□□□□□ -2.51
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