RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	MRPL37	P36532	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YEL057C	P39983	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PIG2	P40187	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YIR035C	P40579	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	OTU1	P43558	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	GAL7	P08431	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SNF5	P18480	905 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ARO7	P32178	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	TIM12	P32830	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YER010C	P40011	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	LRO1	P40345	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	VPS28	Q02767	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	HIP1	P06775	603 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MSK1	P32048	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MIA40	P36046	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	TAT2	P38967	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	DOC1	P53068	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	AKR2	Q12013	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ERV15	P38312	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	POP6	P53218	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YGR042W	P53227	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	FMP48	P53233	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ELP6	Q04868	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CRT10	Q08226	957 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MCP1	Q12106	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SOD2	P00447	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	AAC3	P18238	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
YOR1	YGR281W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ERV46	P39727	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ERV29	P53337	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	APS2	Q00381	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	IRC25	Q07951	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	BSC6	Q08280	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YER121W	P40076	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PTR3	P43606	678 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	GEP7	P53171	287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	OST6	Q03723	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YCT1	Q12235	531 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PET20	Q99373	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PMD1	P32634	1753 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YCR102C	P25608	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PPZ2	P33329	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YKL077W	P36081	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CUE1	P38428	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SOL1	P50278	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SPR6	Q01684	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PFA5	Q03289	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	NPC2	Q12408	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PET122	P10355	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YCK1	P23291	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	LDS1	P31379	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	COQ2	P32378	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CLG1	P35190	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	BNA7	Q04066	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CTS2	Q06350	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SSK1	Q07084	712 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	BMT6	Q12291	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ODC2	Q99297	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MYO1	P08964	1928 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	VEL1	P53058	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	TPN1	P53099	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YPS7	Q06325	596 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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