RNA–Protein interactions for RNA: YGR212W

SLI1, Transcript of N-acetyltransferase, yeast

Gene SLI1, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLI1	YGR212W	HIS2	P38635	335 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLI1	YGR212W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SLI1	YGR212W	YFR018C	P43599	363 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLI1	YGR212W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SLI1	YGR212W	TAF6	P53040	516 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLI1	YGR212W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SLI1	YGR212W	HAL1	Q01766	294 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLI1	YGR212W	CAB5	Q03941	241 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SLI1	YGR212W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	UNG1	P12887	359 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	GPI18	P38211	433 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RRF1	P38771	230 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	CYC2	P38909	366 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SUR7	P54003	302 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SLT2	Q00772	484 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	TSA2	Q04120	196 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	EMI1	Q04406	187 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	LDB18	Q07887	179 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	PLB3	Q08108	686 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
SLI1	YGR212W	EPT1	P22140	391 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	TOA1	P32773	286 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	MOB2	P43563	287 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	CDH1	P53197	566 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	VHT1	P53241	593 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YGR168C	P53293	376 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	CDC14	Q00684	551 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	VHS1	Q03785	461 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RPN6	Q12377	434 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YSR3	P23501	404 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	ACB1	P31787	87 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YBR241C	P38142	488 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	BMT2	P38278	337 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	ITR2	P30606	609 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	MRPL37	P36532	105 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SMF2	P38778	549 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YEL073C	P39974	107 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	PCL7	P40186	285 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	PGU1	P47180	361 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YGR015C	P53208	328 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	HCH1	P53834	153 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RNH201	P53942	307 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	MRPS16	Q02608	121 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RSM10	Q03201	203 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YDR115W	Q04598	105 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YOR376W	Q08900	122 aa		3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YLR462W	O13556	202 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	CYM1	P32898	989 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SHE1	P38200	338 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	LDB7	P38210	180 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YHL049C	P38722	271 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	INA22	P40576	216 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YFL064C	P43540	174 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	BIO3	P50277	480 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YPS5	P53057	165 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	KAP114	P53067	1004 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SAL1	D6W196	494 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	URA10	P30402	227 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	TAF14	P35189	244 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	TCD1	P38756	429 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	FET3	P38993	636 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	PEX22	P39718	180 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	STB1	P42845	420 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	VOA1	P53262	265 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SLD7	Q08457	257 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	DAS2	Q12084	232 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	LDB17	Q12342	491 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	REP1	P03871	373 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	MEI5	P32489	222 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YKL162C	P36052	402 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	YKL071W	P36086	256 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SLI1	YGR212W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93

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