RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BNIP3Q12983 259 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRKG1Q13976 671 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCTD2Q14681 263 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POSTNQ15063 836 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAF5Q15542 800 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DACT2Q5SW24 774 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAXEQ8NCW5 288 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR48Q8TAF3 677 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM167AQ96KS9 214 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RMDN3Q96TC7 470 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGEH1Q9H213 219 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GALNT8Q9NY28 637 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCMF1Q9P0J7 381 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIM2Q9P1W9 311 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VAV3Q9UKW4 847 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF839A8K0R7 811 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNX2O60749 519 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THP07101 528 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STAT5AP42229 794 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PFKPQ01813 784 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZP2Q05996 745 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFATC3Q12968 1075 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAF12Q16514 161 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PFKFB4Q16877 469 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZACNQ401N2 412 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MUL1Q969V5 352 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C18orf8Q96DM3 657 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMX3Q96JJ7 454 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPM1MQ96MI6 270 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10A5Q9H207 317 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCAS3Q9H6U6 928 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STK32BQ9NY57 414 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WASF3Q9UPY6 502 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRYL1Q9Y2S2 319 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1B0GVC2 190 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PPC4 97 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIMM44O43615 452 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLA2G6O60733 806 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CUTAO60888 179 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM127O75204 238 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARIH2O95376 493 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARL4AP40617 200 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC6A9P48067 706 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNAPC2Q13487 334 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TEPPQ6URK8 271 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD163Q86VB7 1156 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC89Q8N998 374 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOX7Q9BT81 388 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS45Q9NRW7 570 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMC4Q9NTJ3 1288 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DACT1Q9NYF0 836 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDP2Q9P2J9 529 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR160Q9UJ42 338 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPTORQ8N122 1335 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms