RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 LAG3P18627 525 aa20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 KCNA5P22460 613 aa20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 IRS1P35568 1242 aa20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 PTENP60484 403 aa20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 EHHADHQ08426 723 aa20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 HYAL1Q12794 435 aa20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.07■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 ZNF623O75123 536 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 HIP1RO75146 1068 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 FGF18O76093 207 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 SKIP12755 728 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 IDEP14735 1019 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 GLRA2P23416 452 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 POU5F1BQ06416 359 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 CAPSQ13938 189 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 MORC3Q14149 939 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 LPPQ93052 612 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 DRC1Q96MC2 740 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.06■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 PANK4Q9NVE7 773 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 RAB27AP51159 221 aa20.05■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 ZNF445P59923 1031 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.05■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.05■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 KIFAP3Q92845 792 aa20.05■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.05■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 EXOC1Q9NV70 894 aa20.05■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 FAM13AO94988 1023 aa20.04■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 LTBRP36941 435 aa20.04■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 COASYQ13057 564 aa20.04■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 TFDP1Q14186 410 aa20.04■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 UBXN11Q5T124 520 aa20.04■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.04■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.04■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.04■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.04■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 TSPAN1O60635 241 aa20.03■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 CCDC192P0DO97 292 aa20.03■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 BMP6P22004 513 aa20.03■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 PLCB3Q01970 1234 aa20.03■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.03■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 TYRO3Q06418 890 aa20.03■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 PSMD2Q13200 908 aa20.03■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 AMHR2Q16671 573 aa20.03■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF558Q96NG5 402 aa20.03■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 SFI1A8K8P3 1242 aa20.02■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.02■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.02■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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PTX4-201ENST00000293922 OFD1O75665 1012 aa20.02■□□□□ 0.79
PTX4-201ENST00000293922 AXLP30530 894 aa20.02■□□□□ 0.79
PTX4-201ENST00000293922 ERVFC1P60507 584 aa20.02■□□□□ 0.79
PTX4-201ENST00000293922 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PTX4-201ENST00000293922 STK4Q13043 487 aa20.02■□□□□ 0.79
PTX4-201ENST00000293922 STX1AQ16623 288 aa20.02■□□□□ 0.79
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