RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	UROD	P06132	367 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MYB	P10242	640 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MLH1	P40692	756 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	RFC5	P40937	340 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CLCN5	P51795	746 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	AK2	P54819	239 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	DSC1	Q08554	894 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	SCRN1	Q12765	414 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TDG	Q13569	410 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GAD1	Q99259	594 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	RFPL2	O75678	378 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ALDH2	P05091	517 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	AOC1	P19801	751 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	SCNN1G	P51170	649 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	EPHA7	Q15375	998 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PPME1	Q9Y570	386 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	FRYL	O94915	3013 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	COL4A3	Q01955	1670 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TBX3	O15119	743 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ERLIN2	O94905	339 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA4	P13612	1032 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1G1	P47890	313 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GLUD2	P49448	558 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PTEN	P60484	403 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPS	Q13938	189 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	AMHR2	Q16671	573 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	SIX5	Q8N196	739 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MYADM	Q96S97	322 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MTR	Q99707	1265 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CLUH	O75153	1309 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	WNT7A	O00755	349 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GALT5	O43286	388 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GLUD1	P00367	558 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ADH1A	P07327	375 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	DSG1	Q02413	1049 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	NR5A1	Q13285	461 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.3	□□□□□ -0.28

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