RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HPS3Q969F9 1004 aa26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STRA6Q9BX79 667 aa26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EXOC1Q9NV70 894 aa26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.34■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RPN1P04843 607 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYBP10242 640 aa26.33■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CASP5P51878 434 aa26.33■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.33■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP4K3Q8IVH8 894 aa26.33■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.33■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.33■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa26.33■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa26.33■■□□□ 1.81
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF623O75123 536 aa26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NPTXRO95502 500 aa26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PNOCQ13519 176 aa26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZPBP2Q6X784 338 aa26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BICD1Q96G01 975 aa26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TLL1O43897 1013 aa26.31■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EOMESO95936 686 aa26.31■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PIGRP01833 764 aa26.31■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RABGGTBP53611 331 aa26.31■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa26.31■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF169Q8NCN4 708 aa26.31■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa26.31■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COL4A6Q14031 1691 aa26.31■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PROZP22891 400 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LIG4P49917 911 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PSMD2Q13200 908 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAB30Q15771 203 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GLIS3Q8NEA6 775 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PGBD4Q96DM1 585 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACCSQ96QU6 501 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAD9AQ99638 391 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PBX4Q9BYU1 374 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IPPQ9Y573 584 aa26.3■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TOM1L1O75674 476 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DGKIO75912 1065 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RHOBTB3O94955 611 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNB1Q14721 858 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF568Q3ZCX4 644 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MPZL3Q6UWV2 235 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 YME1L1Q96TA2 773 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC39A2Q9NP94 309 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EXOC7Q9UPT5 735 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 INSL6Q9Y581 213 aa26.29■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABLIM1O14639 778 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HOXA2O43364 376 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SMC2O95347 1197 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGFR1P11362 822 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNA1Q09470 495 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HACE1Q8IYU2 909 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LPPQ93052 612 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CDT1Q9H211 546 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF19AQ9NV58 838 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MSRAQ9UJ68 235 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBE4BO95155 1302 aa26.28■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LAMA3Q16787 3333 aa26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MCF2P10911 925 aa26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITGA4P13612 1032 aa26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PBX2P40425 430 aa26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCHPQ9BT92 498 aa26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM206Q9H813 350 aa26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HES2Q9Y543 173 aa26.27■■□□□ 1.8
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYOGP15173 224 aa26.26■■□□□ 1.79
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DNAJB2P25686 324 aa26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms