RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 E2F8A0AVK6 867 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 KLHL33A6NCF5 533 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 CCER2I3L3R5 266 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 CYR61O00622 381 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 ABLIM3O94929 683 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 CCND1P24385 295 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 PPARAQ07869 468 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 SPIDRQ14159 915 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 CLUL1Q15846 466 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 AGBL4Q5VU57 503 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 TSPEARQ8WU66 669 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 DPP7Q9UHL4 492 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 SUV39H1O43463 412 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 RAD17O75943 681 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 OSMP13725 252 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 SLC5A3P53794 718 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 ODF1Q14990 250 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 TBR1Q16650 682 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 GAREM2Q75VX8 874 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 JADE3Q92613 823 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP6O43182 974 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 NRP2O60462 931 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 STAT5BP51692 787 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 ANO4Q32M45 955 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 TMEM240Q5SV17 173 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 CPA6Q8N4T0 437 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 TEKT5Q96M29 485 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 CDH19Q9H159 772 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 VWA7Q9Y334 891 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-204ENST00000542443 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MATN2O00339 956 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MEOX1P50221 254 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CDK17Q00537 523 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 FOXE3Q13461 319 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ACAP2Q15057 778 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 PCOLCEQ15113 449 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 EDAQ92838 391 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 EXTL1Q92935 676 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 WDR92Q96MX6 357 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CSRNP2Q9H175 543 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 DNAI1Q9UI46 699 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 C5AR1P21730 350 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MRE11P49959 708 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 NRG3P56975 720 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 KLF10Q13118 480 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ADRM1Q16186 407 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MAN2A1Q16706 1144 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 USP30Q70CQ3 517 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.51□□□□□ -1.37
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