RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315423.11

TNIP2-201, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP2, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2-201ENST00000315423 KRT39Q6A163 491 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 CBWD2Q8IUF1 395 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 FAM71AQ8IYT1 594 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 PARD3BQ8TEW8 1205 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 MFSD14AQ96MC6 490 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 HINFPQ9BQA5 517 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 OSGEPQ9NPF4 335 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 HOXC10Q9NYD6 342 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 AFAP1L1Q8TED9 768 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 BSNDQ8WZ55 320 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 KCNN1Q92952 543 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 KCNG1Q9UIX4 513 aa27.17■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SIP14410 1827 aa27.16■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 PTPRFP10586 1907 aa27.16■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 CARSP49589 748 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 GPC3P51654 580 aa27.16■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 TAF3Q5VWG9 929 aa27.16■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 PALB2Q86YC2 1186 aa27.16■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SHC3Q92529 594 aa27.16■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 THAP2Q9H0W7 228 aa27.16■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa27.16■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 OPA1O60313 960 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 ABCB4P21439 1286 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 GARTP22102 1010 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SCP2P22307 547 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 MFAP3P55082 362 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 CLUL1Q15846 466 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 C11orf63Q6NUN7 778 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 ABHD15Q6UXT9 468 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SLC20A1Q8WUM9 679 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 ARHGEF26Q96DR7 871 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 CARD9Q9H257 536 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 TAS2R14Q9NYV8 317 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 GOLGA8IPA6NC78 632 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 GOLGA8JA6NMD2 632 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 GZMAP12544 262 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 ACTR2P61160 394 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 PRKCEQ02156 737 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 CUL1Q13616 776 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SLC39A4Q6P5W5 647 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 NFU1Q9UMS0 254 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa27.15■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 GOLGA8KD6RF30 607 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 HSF2BPO75031 334 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 SWSAP1Q6NVH7 229 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 KLHL7Q8IXQ5 586 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 EPS8L1Q8TE68 723 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 CYP26B1Q9NR63 512 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 GPRC5DQ9NZD1 345 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
TNIP2-201ENST00000315423 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa27.14■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 RTN2O75298 545 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 DNERQ8NFT8 737 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 SAAL1Q96ER3 474 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 KREMEN1Q96MU8 473 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 GGA3Q9NZ52 723 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 KRIT1O00522 736 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 ICAM3P32942 547 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 CYP24A1Q07973 514 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 XKR3Q5GH77 459 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 FBXL13Q8NEE6 735 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 CHST13Q8NET6 341 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 IFT74Q96LB3 600 aa27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.12■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 RPS6KA5O75582 802 aa27.12■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 MTA2O94776 668 aa27.12■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 PPFIA1Q13136 1202 aa27.12■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 PPP2R5EQ16537 467 aa27.12■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.12■■□□□ 1.93
TNIP2-201ENST00000315423 GPD1LQ8N335 351 aa27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms