RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	YCR041W	P37265	110 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ARN1	P38731	627 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SRP14	P38985	146 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	FRT2	P39734	528 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	VAB2	P40003	282 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ALG8	P40351	577 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ICE2	P40499	491 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ASG7	P46993	209 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YJR079W	P47126	109 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MIC26	P50087	233 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SWF1	Q04629	336 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	DIC1	Q06143	298 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	GAT3	Q07928	141 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	IZH4	Q99393	312 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PSK1	P31374	1356 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.72	□□□□□ -1.81	not detected
SYF1	YDR416W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	POF1	P25576	258 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YOX1	P34161	385 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YNR048W	P53740	393 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YDC1	Q02896	317 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	VPS60	Q03390	229 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	BET5	Q03630	159 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YET3	Q07451	203 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MCA1	Q08601	432 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	JLP1	Q12358	412 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	KRE5	P22023	1365 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	SPO11	P23179	398 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YEF1	P32622	495 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	NUF2	P33895	451 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ECM8	P38246	354 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MST27	P53176	234 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	YGR035C	P53222	116 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	NUP100	Q02629	959 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MHR1	Q06630	226 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	BI2	P03873	423 aa		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	GIT1	P25346	518 aa		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	GPX2	P38143	162 aa		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	CHK1	P38147	527 aa		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	BMT5	P40493	336 aa		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	AGE2	P40529	298 aa		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.71	□□□□□ -1.81	not detected
SYF1	YDR416W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	BNA5	Q05979	453 aa		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	TMS1	Q12116	473 aa		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	DCN1	Q12395	269 aa		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	YDR416W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	URA6	P15700	204 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	EHD3	P28817	500 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	CUE1	P38428	203 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	PCL5	P38794	229 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	GDS1	P41913	522 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	IRC7	P43623	340 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YNL095C	P53932	642 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	GLO2	Q05584	274 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	TUS1	Q06412	1307 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	VPH2	P32341	215 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	GEP4	P38812	185 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	PAC2	P39937	518 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YAT2	P40017	923 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YJR012C	P47087	207 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	MAL13	P53338	473 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	PRM6	Q04705	352 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	CTR3	Q06686	241 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	ESA1	Q08649	445 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	SLY1	P22213	666 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	QRI5	P32344	111 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YKR073C	P36153	106 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YHK8	P38776	514 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	SOK1	P40317	901 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	MTM1	P53320	366 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YLR460C	P54007	376 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	STP1	Q00947	519 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	SNX41	Q04053	625 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	MFG1	Q07684	458 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YLR012C	Q07927	99 aa		3.7	□□□□□ -1.82

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