RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YDL199CQ12407 687 aa4.8□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W KCS1Q12494 1050 aa4.8□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W COX2P00410 251 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CDC6P09119 513 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W HAP3P13434 144 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PDA1P16387 420 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PPH21P23594 369 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PHO90P39535 881 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W VPS73P53142 486 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PNC1P53184 216 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W MKC7P53379 596 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YMR187CQ03236 431 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TPO3Q06451 622 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ENV7Q12003 364 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YDR018CQ12185 396 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YLR099W-AQ3E798 87 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W IDH2P28241 369 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W EHD3P28817 500 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W NGR1P32831 672 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W FSH1P38777 243 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CKB2P38930 258 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YAR028WP39548 234 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W HEM14P40012 539 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W GZF3P42944 551 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SSY5P47002 699 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W MDM34P53083 459 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data4.79□□□□□ -1.64not detected
CYK3YDL117W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TDH2P00358 332 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data4.79□□□□□ -1.64not detected
CYK3YDL117W RAD52P06778 471 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SAT4P25333 603 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CAT2P32796 670 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SRP14P38985 146 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SNU13P39990 126 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ERG28P40030 148 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W BAP3P41815 604 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W GLR1P41921 483 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TOS3P43637 560 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W MCM22P47167 239 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PHO23P50947 330 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SKP1P52286 194 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W MRPS16Q02608 121 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YET2Q04210 160 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W DAL4Q04895 635 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CNL1Q06333 122 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PAM18Q07914 168 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RAD28Q12021 506 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RKM5Q12367 367 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YOL159C-AQ3E769 90 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YCR075W-AQ3E830 75 aa4.79□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CDC33P07260 213 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YCR023CP25351 611 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PET18P25362 215 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ADH7P25377 361 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W URK1P27515 501 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data4.78□□□□□ -1.64not detected
CYK3YDL117W TUL1P36096 758 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PRY2P36110 329 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W GEX2P36173 615 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W QDR3P38227 689 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ALP1P38971 573 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W JHD1P40034 492 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YCH1P42937 148 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W FAR3P46671 204 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PLB2Q03674 706 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SDH7Q04401 133 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W AGE1Q04412 482 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W HLR1Q04429 423 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PEX27Q08580 376 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PTC5Q12511 572 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W MHT1Q12525 324 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W AI1P03875 834 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CDC4P07834 779 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W MET22P32179 357 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W MF(ALPHA)2P32435 120 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W MDL2P33311 773 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SRY1P36007 326 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W FLO10P36170 1169 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data4.78□□□□□ -1.64not detected
CYK3YDL117W MOB1P40484 314 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YFL052WP43551 465 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W UPS3Q04006 179 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.5 ms