RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 CSRNP2Q9H175 543 aa26.52■■□□□ 1.84
SMKR1-201ENST00000462322 C2orf40Q9H1Z8 148 aa26.52■■□□□ 1.84
SMKR1-201ENST00000462322 PBX3P40426 434 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 NAMPTP43490 491 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 KCNQ1P51787 676 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 RESTQ13127 1097 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 HYIQ5T013 277 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 AK8Q96MA6 479 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PNMA5Q96PV4 448 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PLIN2Q99541 437 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 RSAD1Q9HA92 442 aa26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 ITGA4P13612 1032 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 IRS1P35568 1242 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PPM1AP35813 382 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 CABP7Q86V35 215 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 URGCPQ8TCY9 931 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PPP2R3CQ969Q6 453 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 SPG21Q9NZD8 308 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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SMKR1-201ENST00000462322 IPPQ9Y573 584 aa26.5■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa26.49■■□□□ 1.83
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SMKR1-201ENST00000462322 LIG1P18858 919 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 KCNA5P22460 613 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PLCB3Q01970 1234 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 KCTD17Q8N5Z5 321 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 FZD8Q9H461 694 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 TLR9Q9NR96 1032 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 CLIC4Q9Y696 253 aa26.49■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GUA9 196 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 NCK2O43639 380 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 STX6O43752 255 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
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SMKR1-201ENST00000462322 KRT17Q04695 432 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 HYAL1Q12794 435 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 MAPK6Q16659 721 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 FAM187BQ17R55 369 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 SLC27A1Q6PCB7 646 aa26.48■■□□□ 1.83
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SMKR1-201ENST00000462322 GBP3Q9H0R5 595 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 IGFLR1Q9H665 355 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 UBN1Q9NPG3 1134 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 LZTS1Q9Y250 596 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 HES2Q9Y543 173 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 XIRP2A4UGR9 3374 aa26.48■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 VCANP13611 3396 aa26.48■■□□□ 1.83
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SMKR1-201ENST00000462322 NPTXRO95502 500 aa26.47■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PRKCBP05771 671 aa26.47■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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SMKR1-201ENST00000462322 HACE1Q8IYU2 909 aa26.47■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 SLC39A11Q8N1S5 342 aa26.47■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa26.47■■□□□ 1.83
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SMKR1-201ENST00000462322 APOL6Q9BWW8 343 aa26.47■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 RNF39Q9H2S5 420 aa26.47■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 CLDND1Q9NY35 253 aa26.47■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa26.47■■□□□ 1.83
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SMKR1-201ENST00000462322 SLC26A4O43511 780 aa26.46■■□□□ 1.83
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SMKR1-201ENST00000462322 ERVFC1P60507 584 aa26.46■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 GRIN1Q05586 938 aa26.46■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 COL19A1Q14993 1142 aa26.46■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.46■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 DRC1Q96MC2 740 aa26.46■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.46■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.46■■□□□ 1.83
SMKR1-201ENST00000462322 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.46■■□□□ 1.83
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