RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 INTUQ9ULD6 942 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 UBE4BO95155 1302 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 DPEP1P16444 411 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 CHRNB2P17787 502 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 NR1D1P20393 614 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 ZNF844Q08AG5 666 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 RASA3Q14644 834 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 TTLL6Q8N841 843 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 RIPK3Q9Y572 518 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 MYO1FO00160 1098 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 PLS3P13797 630 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 QARSP47897 775 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 CXCL9Q07325 125 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 BSNDQ8WZ55 320 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 ALG6Q9Y672 507 aa16.85■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 CYP26A1O43174 497 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 KRT13P13646 458 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 ANXA13P27216 316 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 KCND2Q9NZV8 630 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 ASNSP08243 561 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 SP4Q02446 784 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 PGM5Q15124 567 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 NSMFQ6X4W1 530 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 C18orf8Q96DM3 657 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD62A6NC57 917 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 TBC1D12O60347 775 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 PLA2G6O60733 806 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 MMEP08473 750 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 CORO7P57737 925 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 CD302Q8IX05 232 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 ACCSQ96QU6 501 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-202ENST00000420808 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 CCDC169A6NNP5 214 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 MUTP22033 750 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 TMOD1P28289 359 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 LSP1P33241 339 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 TRAF1Q13077 416 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 CUL1Q13616 776 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 MESDQ14696 234 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 XKR9Q5GH70 373 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 FAM107BQ9H098 131 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 BCRP11274 1271 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 VCAM1P19320 739 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 MTMR2Q13614 643 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 ANO5Q75V66 913 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.83■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 CCDC188H7C350 402 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 MXI1P50539 228 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 GTF2BQ00403 316 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 C2CD6Q53TS8 623 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 TEPSINQ96N21 525 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 SNX24Q9Y343 169 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 SHBGP04278 402 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 COMTP21964 271 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 TTC27Q6P3X3 843 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 RMDN3Q96TC7 470 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-202ENST00000420808 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms