RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP3A7	P24462	503 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NLRP5	P59047	1200 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	EML1	O00423	815 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	GFRA3	O60609	400 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	OFD1	O75665	1012 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	GALT	P07902	379 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	MTHFR	P42898	656 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC11A1	P49279	550 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ST18	O60284	1047 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF623	O75123	536 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NPEPPS	P55786	919 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	VAV3	Q9UKW4	847 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DDHD2	O94830	711 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DNM2	P50570	870 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB27A	P51159	221 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	INF2	Q27J81	1249 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DTNB	O60941	627 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DEXI	O95424	95 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMC5	P62195	406 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CABP7	Q86V35	215 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	LILRB3	O75022	631 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SKI	P12755	728 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMA5	P28066	241 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CLCN4	P51793	760 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NUBP1	P53384	320 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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