RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 ITGB3P05106 788 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 ENPP1P22413 925 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADAM8P78325 824 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPARAQ07869 468 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 DUSP8Q13202 625 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SURF1Q15526 300 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 CT83Q5H943 113 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLFN13Q68D06 897 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 CLEC14AQ86T13 490 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 CNTD1Q8N815 330 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 WDR92Q96MX6 357 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 ACAP3Q96P50 834 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 C14orf119Q9NWQ9 140 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 NR2E1Q9Y466 385 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 C2orf78A6NCI8 922 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 LPLP06858 475 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 EVA1CP58658 441 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 LILRA6Q6PI73 481 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GAREM2Q75VX8 874 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 LMF1Q96S06 567 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRSS50Q9UI38 385 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP18Q9UMW8 372 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPR3P46089 330 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPR15P49685 360 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCAND1P57086 179 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 RAC3P60763 192 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAPQ12884 760 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 MTMR1Q13613 665 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 INAVAQ3KP66 663 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 LIMS2Q7Z4I7 341 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GAB3Q8WWW8 586 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 LPPQ93052 612 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 RELTQ969Z4 430 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GNRHR2Q96P88 292 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 JADE2Q9NQC1 790 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 EDARQ9UNE0 448 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF536O15090 1300 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GOLGA8BA8MQT2 603 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAFGO15525 162 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC26A4O43511 780 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM127O75204 238 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 KATNA1O75449 491 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 LY86O95711 162 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GAAP10253 952 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 IARSP41252 1262 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADCY7P51828 1080 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GUCY2FP51841 1108 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 LGALS4P56470 323 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 CD69Q07108 199 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 TCIRG1Q13488 830 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 ACAP1Q15027 740 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 UGT8Q16880 541 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCNK18Q7Z418 384 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPR135Q8IZ08 494 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 TSPEARQ8WU66 669 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPHA2Q96T91 129 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-410P-201ENST00000517006 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms