RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.39■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CEP170P1Q96L14 293 aa20.39■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CD320Q9NPF0 282 aa20.39■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 HCSTQ9UBK5 93 aa20.39■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 FAM50BQ9Y247 325 aa20.39■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 FGF18O76093 207 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 RFC5P40937 340 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 KSR1Q8IVT5 923 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 DYDC2Q96IM9 177 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 IGFLR1Q9H665 355 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 RGL1Q9NZL6 768 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CSPG5O95196 566 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PLCB3Q01970 1234 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CALCRLQ16602 461 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ABI1Q8IZP0 508 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 LRRC43Q8N309 656 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 EFHBQ8N7U6 833 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 TLR9Q9NR96 1032 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 LZTS1Q9Y250 596 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 LINC01565O15544 149 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 TBX10O75333 385 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 SLITRK3O94933 977 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 GJD3Q8N144 294 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 RNF169Q8NCN4 708 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 NLRP4Q96MN2 994 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 MTMR9Q96QG7 549 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 WNT7AO00755 349 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ZBTB39O15060 712 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 NEMFO60524 1076 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 LYPLA2O95372 231 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 SKIP12755 728 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PHKA2P46019 1235 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CYP4A11Q02928 519 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 TCP11Q8WWU5 503 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.852e-8■■■□□ 18.3
TM2D1-211ENST00000496465 TMEM143Q96AN5 459 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 KIF2CQ99661 725 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 FSCN2O14926 492 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ASAP2O43150 1006 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF623O75123 536 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PPM1AP35813 382 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 NRIP1P48552 1158 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 FOSBP53539 338 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ERVFC1P60507 584 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 EMC2Q15006 297 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 XKR9Q5GH70 373 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 TPH2Q8IWU9 490 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 HELQQ8TDG4 1101 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF558Q96NG5 402 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 CD207Q9UJ71 328 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.33■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 MBTPS2O43462 519 aa20.33■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 TXKP42681 527 aa20.33■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 RAB27AP51159 221 aa20.33■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 ZP2Q05996 745 aa20.33■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 C8orf34Q49A92 452 aa20.33■□□□□ 0.85
TM2D1-211ENST00000496465 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms