RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 EPC2Q52LR7 807 aa21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 TMEM192Q8IY95 271 aa21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.19■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 A0A0U1RQF3 1178 aa21.18■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.18■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.18■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.18■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.18■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 BMPR1AP36894 532 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 PTENP60484 403 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 RNF149Q8NC42 400 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 DACT1Q9NYF0 836 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 ARID2Q68CP9 1835 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 H3BNC9 293 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 EOMESO95936 686 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 RB1P06400 928 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 CYP11B2P19099 503 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 GLRA2P23416 452 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 CDC25AP30304 524 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 HYIQ5T013 277 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 KRT79Q5XKE5 535 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 RNF19AQ9NV58 838 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 MTMR6Q9Y217 621 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 PP2D1A8MPX8 630 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 BMP15O95972 392 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 GATMP50440 423 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 RESTQ13127 1097 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 CAPSQ13938 189 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 TFDP1Q14186 410 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 PADI6Q6TGC4 694 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
NISCH-209ENST00000485765 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 PHKA2P46019 1235 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 PLVAPQ9BX97 442 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 DNM3Q9UQ16 869 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 STX6O43752 255 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 ZNF623O75123 536 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 EYA4O95677 639 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 FGFR1P11362 822 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 GPM6BQ13491 265 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 HSCBQ8IWL3 235 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 AK8Q96MA6 479 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 CASD1Q96PB1 797 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 HOXA2O43364 376 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 SKIP12755 728 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 CTNNB1P35222 781 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 AMHR2Q16671 573 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 KCNK18Q7Z418 384 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 P2RX5Q93086 422 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 PNMA5Q96PV4 448 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 UNC80Q8N2C7 3258 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 E9PMD0 336 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-209ENST00000485765 SLC26A4O43511 780 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms