RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ANO5Q75V66 913 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ABI1Q8IZP0 508 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 RDM1Q8NG50 284 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 OXER1Q8TDS5 423 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 LPPQ93052 612 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ZNF558Q96NG5 402 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 TCF25Q9BQ70 676 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 CDH22Q9UJ99 828 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 TECTAO75443 2155 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 A0A0U1RQF3 1178 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 NPEPPSP55786 919 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PLCB3Q01970 1234 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 KCNC3Q14003 757 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 LRRC43Q8N309 656 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 VAV3Q9UKW4 847 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 LZTS1Q9Y250 596 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 FAM205CA6NFA0 338 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 HOXA2O43364 376 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 CTDNEP1O95476 244 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 TECP42680 631 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 NLRP4Q96MN2 994 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 S1PR5Q9H228 398 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 SPG21Q9NZD8 308 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 EOMESO95936 686 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PHKA2P46019 1235 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 BCAR1P56945 870 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PSMC5P62195 406 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 GALNT17Q6IS24 598 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 TMC7Q7Z402 723 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 SUSD6Q92537 303 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 HAS1Q92839 578 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ARID2Q68CP9 1835 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB39O15060 712 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 B4GALT3O60512 393 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PFKFB2O60825 505 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 DNM2P50570 870 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 NEK4P51957 841 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 KRT17Q04695 432 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 PPP2R5CQ13362 524 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 NEK8Q86SG6 692 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 POTEDQ86YR6 584 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 NECAB1Q8N987 351 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 EDAQ92838 391 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 TMEM143Q96AN5 459 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 DACT1Q9NYF0 836 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 RGL1Q9NZL6 768 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.15□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.14□□□□□ -0.155e-69■□□□□ 8.2
PRAME-212ENST00000485532 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 LARGE1O95461 756 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.14□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 CA8P35219 290 aa14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms