RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LZTS1Q9Y250 596 aa29.38■■■□□ 2.29
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EOMESO95936 686 aa29.37■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCB3Q01970 1234 aa29.37■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G4FQ68DD2 849 aa29.37■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNT2Q6UVM3 1135 aa29.37■■■□□ 2.29
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAS1Q92839 578 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP4Q96MN2 994 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT2P35908 639 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PBX3P40426 434 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPEPPSP55786 919 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT17Q04695 432 aa29.33■■■□□ 2.29
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KSR1Q8IVT5 923 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC7A3Q8WY07 619 aa29.33■■■□□ 2.29
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP170P1Q96L14 293 aa29.32■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAIPQ9BWF2 469 aa29.32■■■□□ 2.28
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ME3Q16798 604 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCAPH2Q6IBW4 605 aa29.31■■■□□ 2.28
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLFN12Q8IYM2 578 aa29.31■■■□□ 2.28
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFC5P40937 340 aa29.3■■■□□ 2.28
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4orf19Q8IY42 314 aa29.3■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VN1R2Q8NFZ6 395 aa29.3■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LARGE1O95461 756 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRGAP2BP0DMP2 458 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTUD6AQ7L8S5 288 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMC7Q7Z402 723 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC39A11Q8N1S5 342 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPH1Q8WYR4 309 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGL1Q9NZL6 768 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YWHABP31946 246 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF135Q8IUD6 432 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
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