RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa29.84■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 ARID2Q68CP9 1835 aa29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 GRXCR2A6NFK2 248 aa29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 EP400NLQ6ZTU2 488 aa29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 TCP11Q8WWU5 503 aa29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 DYDC2Q96IM9 177 aa29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 CASD1Q96PB1 797 aa29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 CWH43Q9H720 699 aa29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 RGL1Q9NZL6 768 aa29.83■■■□□ 2.37
ODC1-204ENST00000446285 H3BQ06 376 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 FGFR4P22455 802 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 DNAJB1P25685 340 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 C8orf34Q49A92 452 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 CCDC83Q8IWF9 413 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 THNSL1Q8IYQ7 743 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 C8orf76Q96K31 380 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 NLRP4Q96MN2 994 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 RNF19AQ9NV58 838 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 FSD2A1L4K1 749 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 ASAP2O43150 1006 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 FGF18O76093 207 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 LYPLA2O95372 231 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 PPM1AP35813 382 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 FOSBP53539 338 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 CYP4A11Q02928 519 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 LZTS1Q9Y250 596 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 SLITRK3O94933 977 aa29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 RAB27AP51159 221 aa29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 XKR9Q5GH70 373 aa29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 CATSPER4Q7RTX7 472 aa29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 TPH2Q8IWU9 490 aa29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 MTMR9Q96QG7 549 aa29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 HSD17B14Q9BPX1 270 aa29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 TLR9Q9NR96 1032 aa29.8■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 CARNS1A5YM72 827 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 IL9P15248 144 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 LTBRP36941 435 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 PHKA2P46019 1235 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 PLCB3Q01970 1234 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 EMC2Q15006 297 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 KSR1Q8IVT5 923 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 FAM178BQ8IXR5 827 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 RNF169Q8NCN4 708 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 MTRQ99707 1265 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 IFT122Q9HBG6 1241 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 ANKEF1Q9NU02 776 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 CSPG5O95196 566 aa29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 IRS1P35568 1242 aa29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 TXKP42681 527 aa29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 CLLU1OSQ5K130 101 aa29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 EFHBQ8N7U6 833 aa29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 ZNF558Q96NG5 402 aa29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 KIF2CQ99661 725 aa29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 PRKAG3Q9UGI9 489 aa29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 ADAM15Q13444 863 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.367e-8■■■■□ 22.6
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ODC1-204ENST00000446285 LRRC55Q6ZSA7 311 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 TMEM143Q96AN5 459 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 IGFLR1Q9H665 355 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 HCSTQ9UBK5 93 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-204ENST00000446285 ZNF623O75123 536 aa29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 RBM25P49756 843 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 FERMT3Q86UX7 667 aa29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 FAM105AQ9NUU6 356 aa29.76■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 WNT7AO00755 349 aa29.75■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 DGAT1O75907 488 aa29.75■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 GUCY1B3Q02153 619 aa29.75■■■□□ 2.35
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