RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 NELFBQ8WX92 580 aa26.82■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 MRFAP1Q9Y605 127 aa26.82■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 TRIM49BA6NDI0 452 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ZNF286BP0CG31 522 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ZNF131P52739 623 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA1Q92805 767 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 CEP89Q96ST8 783 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 LCMT1Q9UIC8 334 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 CYBAP13498 195 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PPP2R3AQ06190 1150 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PAK1Q13153 545 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PLCB4Q15147 1175 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 MYCT1Q8N699 235 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PARD6BQ9BYG5 372 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PARVGQ9HBI0 331 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.81■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 TRIM66O15016 1216 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 MMP3P08254 477 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 MAGEA9P43362 315 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 TLK2Q86UE8 772 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 FIZ1Q96SL8 496 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 BRCA2P51587 3418 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 FANCGO15287 622 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 FKTNO75072 461 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 MFSD14CQ5VZR4 134 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 FANCLQ9NW38 375 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 FAM184BQ9ULE4 1060 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 LMAN1P49257 510 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 RNPEPQ9H4A4 650 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ZBTB42B2RXF5 422 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 MYBP10242 640 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 GAP43P17677 238 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 C1QTNF8P60827 252 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 LONRF2Q1L5Z9 754 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ATP8B4Q8TF62 1192 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 NRBP2Q9NSY0 501 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PPFIA4O75335 1185 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 NMT1P30419 496 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 OLFML3Q9NRN5 406 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PSMA7O14818 248 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 DGAT1O75907 488 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 STIM1Q13586 685 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ODR4Q5SWX8 454 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 A6NJR5 290 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ATP1A3P13637 1013 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 AKR1A1P14550 325 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 VSTM4Q8IW00 320 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 FAM167AQ96KS9 214 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ERAP1Q9NZ08 941 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ADCY3O60266 1144 aa26.76■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 HOXD10P28358 340 aa26.76■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 EMC2Q15006 297 aa26.76■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.76■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 P2RX5Q93086 422 aa26.76■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 TRPC6Q9Y210 931 aa26.76■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 CCNE1P24864 410 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 HOXD13P35453 343 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 BEX3Q00994 111 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 SPATA1Q5VX52 437 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 TTI2Q6NXR4 508 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 BSNDQ8WZ55 320 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 GCNT3O95395 438 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CTU1-201ENST00000421832 CNGA1P29973 690 aa26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms