RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 CEP170P1Q96L14 293 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHST12Q9NRB3 414 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 IRS1P35568 1242 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 DNM2P50570 870 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 EOMESO95936 686 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 KCNA5P22460 613 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 EMC2Q15006 297 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 POF1BQ8WVV4 589 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 POTEMA6NI47 508 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOXA2O43364 376 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF623O75123 536 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.816e-6■□□□□ 10.3
TRAPPC3-202ENST00000373162 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 TXKP42681 527 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 PHKA2P46019 1235 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBE3AQ05086 875 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 RABEP1Q15276 862 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 FERMT3Q86UX7 667 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM143Q96AN5 459 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 FSCN2O14926 492 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 TBX10O75333 385 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 RARRES1P49788 294 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLCB3Q01970 1234 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 XKR9Q5GH70 373 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRRC43Q8N309 656 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 NLRP4Q96MN2 994 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 SCLT1Q96NL6 688 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 CD320Q9NPF0 282 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 DACT1Q9NYF0 836 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-202ENST00000373162 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 MARCH6O60337 910 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 FGF18O76093 207 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 IL9P15248 144 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 LAG3P18627 525 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 MCM7P33993 719 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBXN11Q5T124 520 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 TPH2Q8IWU9 490 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 IL27Q8NEV9 243 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 LZTS1Q9Y250 596 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 LINC01565O15544 149 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 NCK2O43639 380 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 MED24O75448 989 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARL2P36404 184 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRAPPC10P48553 1259 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 POU5F1BQ06416 359 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADAM15Q13444 863 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 TCP11Q8WWU5 503 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 MTRQ99707 1265 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 ASAP2O43150 1006 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 DGAT1O75907 488 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 GLP2RO95838 553 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR52Z1P0C646 297 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTENP60484 403 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERVFC1P60507 584 aa20.05■□□□□ 0.8
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