RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 USO1O60763 962 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
INO80B-201ENST00000233331 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
INO80B-201ENST00000233331 IFT122Q9HBG6 1241 aa34.14■■■■□ 3.06
INO80B-201ENST00000233331 TMEM161AQ9NX61 479 aa34.14■■■■□ 3.06
INO80B-201ENST00000233331 RWDD3Q9Y3V2 267 aa34.14■■■■□ 3.06
INO80B-201ENST00000233331 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
INO80B-201ENST00000233331 LINC00271P0C7V0 271 aa34.13■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 PRPHP41219 470 aa34.13■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 FAM189BP81408 668 aa34.13■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 CATSPER4Q7RTX7 472 aa34.13■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 ASAP2O43150 1006 aa34.12■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 PDCP20941 246 aa34.12■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 GPM6BQ13491 265 aa34.12■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 DTHD1Q6ZMT9 781 aa34.12■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 IGSF22Q8N9C0 903 aa34.12■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 RNF149Q8NC42 400 aa34.12■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 DACT1Q9NYF0 836 aa34.12■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 TBKBP1A7MCY6 615 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 PDIA5Q14554 519 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 FAM102BQ5T8I3 360 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 ECHDC2Q86YB7 292 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 SNX29Q8TEQ0 813 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 PRDM6Q9NQX0 595 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 CHST12Q9NRB3 414 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 LMCD1Q9NZU5 365 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 STK24Q9Y6E0 443 aa34.11■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 H3BNC9 293 aa34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 FGFR1P11362 822 aa34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 MUTP22033 750 aa34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 BMPR1AP36894 532 aa34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 IL17AQ16552 155 aa34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 RNF169Q8NCN4 708 aa34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 ASAP3Q8TDY4 903 aa34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 FOXD4L1Q9NU39 408 aa34.1■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 PHKA2P46019 1235 aa34.09■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 TFDP1Q14186 410 aa34.09■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 BRAPQ7Z569 592 aa34.09■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 MINDY3Q9H8M7 445 aa34.09■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 KIAA1671Q9BY89 1806 aa34.09■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF35A5YM69 484 aa34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 PP2D1A8MPX8 630 aa34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 C5orf67F2Z3F1 127 aa34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 RB1P06400 928 aa34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 ARL2P36404 184 aa34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 ECM1Q16610 540 aa34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 MAEAQ7L5Y9 396 aa34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
INO80B-201ENST00000233331 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa34.07■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 A0A0U1RQF3 1178 aa34.07■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 HOXA2O43364 376 aa34.07■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 CAPSQ13938 189 aa34.07■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 KRT79Q5XKE5 535 aa34.07■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 MCPH1Q8NEM0 835 aa34.07■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa34.07■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 KIAA1024Q9UPX6 916 aa34.07■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 GLRA2P23416 452 aa34.06■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 PTPROQ16827 1216 aa34.06■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 PADI6Q6TGC4 694 aa34.06■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 SNX21Q969T3 373 aa34.06■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 GPRC5CQ9NQ84 441 aa34.06■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 PTENP60484 403 aa34.05■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 ABI1Q8IZP0 508 aa34.05■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 PLVAPQ9BX97 442 aa34.05■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 TMEM117Q9H0C3 514 aa34.05■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 RNF19AQ9NV58 838 aa34.05■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 THEGQ9P2T0 379 aa34.05■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 SYT1P21579 422 aa34.04■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 CDC25AP30304 524 aa34.04■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 VWA3AA6NCI4 1184 aa34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 ERLIN2O94905 339 aa34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 EOMESO95936 686 aa34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 HSCBQ8IWL3 235 aa34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 TRAIPQ9BWF2 469 aa34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 BHMT2Q9H2M3 363 aa34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 FAM105AQ9NUU6 356 aa34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 HCSTQ9UBK5 93 aa34.03■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 POU5F1BQ06416 359 aa34.02■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 CASD1Q96PB1 797 aa34.02■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
INO80B-201ENST00000233331 GRM6O15303 877 aa34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.9 ms