RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MED15Q96RN5 788 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 SLC16A4O15374 487 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ZEB2O60315 1214 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 VTNP04004 478 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 GLRA2P23416 452 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF131P52739 623 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 C7orf31Q8N865 590 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 KCND2Q9NZV8 630 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC169A6NNP5 214 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 RMND1Q9NWS8 449 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 A0A1W2PQY0 241 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 GCNT3O95395 438 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 PLS3P13797 630 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 ARL2P36404 184 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 RFC5P40937 340 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 NPTX2P47972 431 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 ADAM17P78536 824 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 WNT8BQ93098 351 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 KPNA6O60684 536 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 HOXD13P35453 343 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 ITGA7Q13683 1181 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 ARMC5Q96C12 935 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 DRC1Q96MC2 740 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 NRCAMQ92823 1304 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 K7ENM7 598 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 CAPSQ13938 189 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP4Q96MN2 994 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 AKT3Q9Y243 479 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 CYP2C9P11712 490 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 ADSSL1Q8N142 457 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 KIFAP3Q92845 792 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 GINS2Q9Y248 185 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TISP43B9A030 160 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 KBTBD13C9JR72 458 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 SGPL1O95470 568 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 COL1A2P08123 1366 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 SMTNL1A8MU46 457 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 GAP43P17677 238 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 IER5Q5VY09 327 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 RNF149Q8NC42 400 aa20.47■□□□□ 0.87
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