RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 STK26Q9P289 416 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 ODF2Q5BJF6 829 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 RAD21O60216 631 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 KANK1Q14678 1352 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.251e-24■■■■■ 81.7
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 RILPL2Q969X0 211 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 CDR1P51861 262 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 MLECQ14165 292 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM29Q14134 588 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 H0YHG0 523 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXW7Q969H0 707 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 DCTN1Q14203 1278 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 EPS15P42566 896 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 GSE1Q14687 1217 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 CAGE1Q8TC20 777 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA3Q08378 1498 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRJ-207ENST00000613246 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 MNS1Q8NEH6 495 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 IFT57Q9NWB7 429 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 MYO6Q9UM54 1294 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 BICD2Q8TD16 824 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 CCER2I3L3R5 266 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP162Q5TB80 1403 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 NEFHP12036 1026 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRJ-207ENST00000613246 VPS37DQ86XT2 251 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 PAF1Q8N7H5 531 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 CPLX1O14810 134 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 FOSBP53539 338 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 PDILTQ8N807 584 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC4A3P48751 1232 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 OFD1O75665 1012 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 AMPHP49418 695 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 MSH5O43196 834 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 ERICH2A1L162 156 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 RALBP1Q15311 655 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 TRDNQ13061 729 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRJ-207ENST00000613246 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 249.1 ms