RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 MORC1Q86VD1 984 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 WWC1Q8IX03 1113 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 TAF3Q5VWG9 929 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 FEZ1Q99689 392 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 NEFHP12036 1026 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 FAM161AQ3B820 660 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 USP8P40818 1118 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 KIF15Q9NS87 1388 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 CCP110O43303 1012 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-209ENST00000612229 H0YHG0 523 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 ODF2Q5BJF6 829 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 NLRP13Q86W25 1043 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 PDE4AP27815 886 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 BECN2A8MW95 431 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 H3BQV1 296 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 IFFO2Q5TF58 517 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 FMN1Q68DA7 1419 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 STK31Q9BXU1 1019 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 RABEP1Q15276 862 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 APBB1O00213 710 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 REC8O95072 547 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 ROCK1Q13464 1354 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 AAMPQ13685 434 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 IQCEQ6IPM2 695 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 MNS1Q8NEH6 495 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 KCNH8Q96L42 1107 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 ERLIN2O94905 339 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 KIF3BO15066 747 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 NUCB2P80303 420 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 GORABQ5T7V8 394 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 DEF6Q9H4E7 631 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 NF2P35240 595 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 NGEFQ8N5V2 710 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 PPM1EQ8WY54 764 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-209ENST00000612229 MRE11P49959 708 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF592Q92610 1267 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-209ENST00000612229 MARCH6O60337 910 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.46□□□□□ -1.06
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