RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365172.1

SNORD49B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 49B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD49B, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM212AQ96EL1 285 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PRKD2Q9BZL6 878 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PCDHB8Q9UN66 801 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 NOTCH1P46531 2555 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PYGBP11216 843 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR20EP86478 221 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR20CP86479 221 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR20DP86480 221 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR20BP86481 221 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR20AP86496 221 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PKDCCQ504Y2 493 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 CRIPAKQ8N1N5 446 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 STAC3Q96MF2 364 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 AAASQ9NRG9 546 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 MUC2Q02817 5179 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 SOWAHBA6NEL2 793 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM187AA6NFU0 413 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 GOLGA8CPA6NN73 597 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 TERTO14746 1132 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 KIF3CO14782 793 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 ST8SIA5O15466 376 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 ADAM23O75077 832 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PLEKHG5O94827 1062 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 IGHA1P01876 353 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 GMPRP36959 345 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PSEN1P49768 467 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 BCAMP50895 628 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PPP1R18Q6NYC8 613 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 Q8N3U1 123 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 ANKK1Q8NFD2 765 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 KCNK17Q96T54 332 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 ZBED2Q9BTP6 218 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 NBPF3Q9H094 633 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 TRANK1O15050 2925 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 BAHCC1Q9P281 2608 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 CYSRT1A8MQ03 144 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 GDF9O60383 454 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 GDF11O95390 407 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 AVPP01185 164 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 FOXK2Q01167 660 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 RASSF7Q02833 373 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 TJAP1Q5JTD0 557 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 GPAT2Q6NUI2 795 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM151AQ8N4L1 468 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 MS4A4AQ96JQ5 239 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 KCNH8Q96L42 1107 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 BCL2L12Q9HB09 334 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 CABP2Q9NPB3 220 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 WBP1LQ9NX94 342 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 CUL9Q8IWT3 2517 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 H3BM21 787 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 VASPP50552 380 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 CTC1Q2NKJ3 1217 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 LAPTM4BQ86VI4 370 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 NPAS3Q8IXF0 933 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 MIER1Q8N108 512 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 IRF7Q92985 503 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 TRIM47Q96LD4 638 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 RABGEF1Q9UJ41 708 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD49B-201ENST00000365172 ERBB4Q15303 1308 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD49B-201ENST00000365172 C2orf72A6NCS6 295 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD49B-201ENST00000365172 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD49B-201ENST00000365172 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
SNORD49B-201ENST00000365172 TNFRSF10AO00220 468 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD49B-201ENST00000365172 AXIN1O15169 862 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD49B-201ENST00000365172 KRT37O76014 449 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD49B-201ENST00000365172 PROCP04070 461 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD49B-201ENST00000365172 ITGB2P05107 769 aa0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms