RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Polr3aB2RXC6 1390 aa29.87■■■□□ 2.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtprgQ05909 1442 aa29.86■■■□□ 2.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 L3mbtl2P59178 703 aa29.86■■■□□ 2.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa29.86■■■□□ 2.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AknaQ80VW7 1404 aa29.84■■■□□ 2.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa29.83■■■□□ 2.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rock2P70336 1388 aa29.83■■■□□ 2.37
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Liat1Q810M6 228 aa29.79■■■□□ 2.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgap5P97393 1501 aa29.79■■■□□ 2.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rock1P70335 1354 aa29.78■■■□□ 2.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc4a3P16283 1227 aa29.77■■■□□ 2.36
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa29.76■■■□□ 2.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnh8P59111 1102 aa29.76■■■□□ 2.35
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cd109Q8R422 1442 aa29.75■■■□□ 2.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp7aQ64430 1491 aa29.75■■■□□ 2.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa29.74■■■□□ 2.35
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tarbp1E9Q368 1579 aa29.68■■■□□ 2.34
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm5cP41230 1554 aa29.66■■■□□ 2.34
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa29.66■■■□□ 2.34
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q7TT23 1179 aa29.66■■■□□ 2.34
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa29.65■■■□□ 2.34
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mast1Q9R1L5 1570 aa29.65■■■□□ 2.34
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf17Q99MV7 1640 aa29.64■■■□□ 2.34
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Setd1aE9PYH6 1716 aa29.61■■■□□ 2.33
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa29.61■■■□□ 2.33
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zscan21Q07231 555 aa29.6■■■□□ 2.33
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Egfem1Q8C088 590 aa29.6■■■□□ 2.33
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pank3Q8R2W9 370 aa29.57■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kank1E9Q238 1360 aa29.55■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm14025A2AP89 1413 aa29.55■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adamts13Q769J6 1426 aa29.54■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa29.54■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PrxO55103 1391 aa29.54■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Inpp5dQ9ES52 1191 aa29.53■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cfap74Q3UY96 1578 aa29.52■■■□□ 2.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pde4cQ3UEI1 686 aa29.51■■■□□ 2.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Neurl4Q5NCX5 1563 aa29.5■■■□□ 2.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa29.49■■■□□ 2.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map3k5O35099 1380 aa29.48■■■□□ 2.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa29.48■■■□□ 2.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AI481877A2ALV5 1481 aa29.47■■■□□ 2.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hecw1Q8K4P8 1604 aa29.45■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc3B2RX12 1523 aa29.44■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NhsB1AV60 1647 aa29.44■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cep170Q6A065 1588 aa29.42■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zscan10Q3URR7 782 aa29.41■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Robo2Q7TPD3 1470 aa29.41■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prdm16A2A935 1275 aa29.41■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Erich6D3Z6S9 713 aa29.41■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plch2A2AP18 1501 aa29.39■■■□□ 2.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tulp4Q9JIL5 1547 aa29.37■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm2aP59997 1161 aa29.36■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa29.35■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29.34■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmf1B9EKI3 1091 aa29.34■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa29.34■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Esx1O88933 382 aa29.34■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ShprhQ7TPQ3 1674 aa29.33■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chd1P40201 1711 aa29.33■■■□□ 2.29
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc4a1apE9PX68 744 aa29.33■■■□□ 2.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc1O35379 1528 aa29.32■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abca8bQ8K440 1620 aa29.31■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tex14Q7M6U3 1450 aa29.31■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Srcin1Q9QWI6 1250 aa29.3■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bcl11aQ9QYE3 773 aa29.3■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mink1Q9JM52 1308 aa29.29■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ak9G3UYQ4 1894 aa29.29■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf608Q56A10 1511 aa29.28■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kidins220E9Q9B7 1793 aa29.28■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NeflP08551 543 aa29.28■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nsd2Q8BVE8 1365 aa29.27■■■□□ 2.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa29.26■■■□□ 2.27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CrbnQ8C7D2 445 aa29.24■■■□□ 2.27
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