RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Naip5Q9R016 1403 aa23.2■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ptch1Q61115 1434 aa23.19■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pik3c2gO70167 1506 aa23.19■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myo5cE9Q1F5 1742 aa23.17■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Usp47Q8BY87 1376 aa23.17■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dip2cE9PWR4 1557 aa23.17■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 AdgbG3UZ78 1657 aa23.16■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 RereQ80TZ9 1558 aa23.16■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Robo2Q7TPD3 1470 aa23.15■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pde4cQ3UEI1 686 aa23.15■■□□□ 1.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd109Q8R422 1442 aa23.12■■□□□ 1.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa23.11■■□□□ 1.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kif3bQ61771 747 aa23.11■■□□□ 1.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hecw2Q6I6G8 1578 aa23.11■■□□□ 1.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa23.1■■□□□ 1.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fndc1E9Q043 1732 aa23.08■■□□□ 1.29
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plch2A2AP18 1501 aa23.08■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Synj2Q9D2G5 1434 aa23.07■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.07■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gli2Q0VGT2 1544 aa23.07■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp7aQ64430 1491 aa23.06■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dot1lQ6XZL8 1540 aa23.05■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wdr66E9Q743 1299 aa23.05■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Yeats2Q3TUF7 1407 aa23.05■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Camsap2Q8C1B1 1461 aa23.04■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myom3A2ABU4 1439 aa23.03■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Naip6Q9JIB6 1403 aa23.03■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Abca6Q8K441 1624 aa23.02■■□□□ 1.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Uggt2E9Q4X2 1504 aa23.01■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trpm1Q2TV84 1622 aa23■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nsd2Q8BVE8 1365 aa23■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnajc5P60904 198 aa22.99■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prex1Q69ZK0 1650 aa22.99■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa22.98■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tarbp1E9Q368 1579 aa22.97■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cfap65Q3V0B4 1847 aa22.97■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sall2Q9QX96 1004 aa22.96■■□□□ 1.27
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rgl3Q3UYI5 709 aa22.94■■□□□ 1.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pcgf6Q99NA9 353 aa22.94■■□□□ 1.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 AnkarA2RT91 1465 aa22.94■■□□□ 1.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rock1P70335 1354 aa22.93■■□□□ 1.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa22.91■■□□□ 1.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Neurod1Q60867 357 aa22.91■■□□□ 1.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Qser1A2BIE1 1698 aa22.9■■□□□ 1.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 ClspnQ80YR7 1315 aa22.9■■□□□ 1.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ttc21bQ0HA38 1315 aa22.89■■□□□ 1.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mbd5B1AYB6 1498 aa22.89■■□□□ 1.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Washc2Q6PGL7 1334 aa22.86■■□□□ 1.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Iqgap3F8VQ29 1632 aa22.86■■□□□ 1.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm13697A2AK42 830 aa22.81■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Erich6D3Z6S9 713 aa22.81■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 NpatQ8BMA5 1420 aa22.81■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mug2P28666 1451 aa22.81■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Akap12Q9WTQ5 1684 aa22.79■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnajc5gQ8C632 165 aa22.79■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa22.79■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adamts7Q68SA9 1657 aa22.78■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Abca8aQ8K442 1620 aa22.77■■□□□ 1.24
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adamts13Q769J6 1426 aa22.77■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ino80Q6ZPV2 1559 aa22.74■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Talpid3E9PV87 1520 aa22.74■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Polr3aB2RXC6 1390 aa22.74■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Abcc6Q9R1S7 1498 aa22.74■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sall3Q62255 1320 aa22.74■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 ErbinQ80TH2 1402 aa22.72■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dapk1Q80YE7 1442 aa22.72■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa22.72■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa22.72■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tecpr2Q3UH45 1423 aa22.72■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tulp4Q9JIL5 1547 aa22.72■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa22.71■■□□□ 1.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 Knl1Q66JQ7 1612 aa22.7■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa22.7■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 Afap1Q80YS6 731 aa22.69■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stk24Q99KH8 431 aa22.68■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa22.67■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 Efcab6Q6P1E8 1516 aa22.66■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa22.65■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa22.65■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rundc1Q0VDN7 615 aa22.65■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myom2Q14BI5 1463 aa22.65■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 RictorQ6QI06 1708 aa22.64■■□□□ 1.22
Casq1-201ENSMUST00000003554 AatkQ80YE4 1365 aa22.63■■□□□ 1.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rsph4aQ8BYM7 716 aa22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms