RNA–Protein interactions for RNA: YPR029C

APL4, Transcript of Gamma-adaptin, yeast

Gene APL4, Length 2,499 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APL4	YPR029C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ELO1	P39540	310 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	FKH1	P40466	484 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	BMT5	P40493	336 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	PRK1	P40494	810 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	PMT6	P42934	759 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	MGA1	P53050	456 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	SOL4	P53315	255 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	KIN4	Q01919	800 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	CWC27	Q02770	301 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YLR036C	Q07986	203 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	GAS5	Q08193	484 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ELG1	Q12050	791 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	FYV7	Q12247	151 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ECM3	Q99252	613 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	CHS2	P14180	963 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	AMD2	P22580	549 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	CSG2	P35206	410 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	MED8	P38304	223 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	CUE1	P38428	203 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	UBP5	P39944	805 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	FCY21	P40039	528 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	AZR1	P50080	613 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	MIC26	P50087	233 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	COG5	P53951	403 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	SED5	Q01590	340 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ARL3	Q02804	198 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	TPP1	Q03796	238 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	COQ9	Q05779	260 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ARR3	Q06598	404 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	DCN1	Q12395	269 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	UFD4	P33202	1483 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RAV1	P47104	1357 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	UBC8	P28263	218 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	EHD3	P28817	500 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	SGE1	P33335	543 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YBP1	P38315	674 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	WSC4	P38739	605 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	OXA1	P39952	402 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	POP1	P41812	875 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ASG7	P46993	209 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	TAD2	P47058	250 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YJL016W	P47072	561 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	AIM24	P47127	394 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	USE1	P53146	245 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	MDM30	Q05930	598 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	FRQ1	Q06389	190 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ASR1	Q06834	288 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YPQ1	Q12010	308 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	COR1	P07256	457 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	CPT1	P17898	393 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YHR112C	P38716	378 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	MBB1	P39534	108 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YIR016W	P40572	265 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	TDA10	P42938	290 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	GUF1	P46943	645 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ASI2	P53895	289 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	AAT1	Q01802	451 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	SMP3	Q04174	516 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	PLM2	Q04383	521 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	TEN1	Q07921	160 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	POM33	Q12164	279 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	RTR2	Q12378	196 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ACB1	P31787	87 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YBL010C	P32788	280 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	FMP23	P38231	175 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	TSC10	P38342	320 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	PAC2	P39937	518 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	ICP55	P40051	511 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	YPS6	P40583	537 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	VEL1	P53058	206 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APL4	YPR029C	SLG1	P54867	378 aa		3.47	□□□□□ -1.85

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