RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	EHT1	P38295	451 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CKB2	P38930	258 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PRM2	P40534	656 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	LCB2	P40970	561 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ASK10	P48361	1146 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PHO23	P50947	330 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ALT2	P52892	507 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YGR012W	P53206	393 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TIM8	P57744	87 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SAE3	P89114	91 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TVP18	Q04767	167 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CSM4	Q08955	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	INP53	Q12271	1107 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	EAF3	Q12432	401 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RMD5	Q12508	421 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AI1	P03875	834 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ATP5	P09457	212 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SPO7	P18410	259 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CSG2	P35206	410 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	GMH1	P36125	273 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MRPL28	P36527	147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	FLR1	P38124	548 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RCK1	P38622	512 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	EFM1	P38732	585 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AIM46	P38885	310 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	GAT2	P40209	560 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YFL012W	P43580	148 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AIF1	P52923	378 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YNL181W	P53878	407 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AIM33	Q04516	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SPR28	Q04921	423 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	INM2	Q05533	292 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RGT2	Q12300	763 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	COA6	Q3E846	104 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TAO3	P40468	2376 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	COX6	P00427	148 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SEC59	P20048	519 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	STE50	P25344	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	EMC1	P25574	760 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ASK1	P35734	292 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	DTR1	P38125	572 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	LDH1	P38139	375 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MDM31	P38880	579 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PHO90	P39535	881 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SLZ1	P40167	298 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	NTA1	P40354	457 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	VMA21	P41806	77 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	GAT1	P43574	510 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PHO86	P46956	311 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	DAN1	P47178	298 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	GCV1	P48015	400 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YGL185C	P53100	379 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	COG7	P53195	279 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YGR053C	P53234	283 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SHY1	P53266	389 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	GIM5	Q04493	163 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CDC123	Q05791	360 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AIM6	Q07716	390 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	LDB18	Q07887	179 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RRT8	Q08219	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	INH1	P01097	85 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	HTA2	P04912	132 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CDC34	P14682	295 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AGP1	P25376	633 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	IMG1	P25626	169 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YCR061W	P25639	631 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	EHD3	P28817	500 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MSN2	P33748	704 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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