RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	HSP42	Q12329	375 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	RTN2	Q12443	393 aa		7.62	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	SIR2	P06700	562 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	RNQ1	P25367	405 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	AHC2	P25649	128 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	ACH1	P32316	526 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	HOG1	P32485	435 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	WSC4	P38739	605 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	CIS3	P47001	227 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	IRC18	P47056	224 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	PGA1	P53896	198 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	SPC19	Q03954	165 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	ORM2	Q06144	216 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	YPR196W	Q06595	470 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	CDA2	Q06703	312 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	ERD1	P16151	362 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	FPS1	P23900	669 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	YIL166C	P40445	542 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	SMK1	P41808	388 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	MDV1	P47025	714 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	PLM2	Q04383	521 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	SMA2	Q04658	369 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	GIC2	Q06648	383 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	YDL176W	Q12027	708 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	MMP1	Q12372	583 aa		7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.6	□□□□□ -1.19	not detected
GGA2	YHR108W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.6	□□□□□ -1.19	not detected
GGA2	YHR108W	PTR2	P32901	601 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	EXO84	P38261	753 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	VMA22	P38784	181 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	SIT1	P39980	628 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	YIL165C	P40446	119 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	TIM54	P47045	478 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	DIE2	P50076	525 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	BUD9	P53226	547 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	MRPL13	Q02204	264 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	BUR2	Q05949	395 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	SYO1	Q07395	620 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	YOR365C	Q08844	703 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		7.6	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.59	□□□□□ -1.19	not detected
GGA2	YHR108W	YNL195C	P40168	261 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	YKE4	P40544	346 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	CIN1	P40987	1014 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	SAM37	P50110	327 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	TPN1	P53099	579 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	IMO32	P53219	342 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	ORM1	P53224	222 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	DML1	Q03652	475 aa		7.59	□□□□□ -1.19
GGA2	YHR108W	HOP1	P20050	605 aa		7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	FUN26	P31381	517 aa		7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	SDS22	P36047	338 aa		7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	DTR1	P38125	572 aa		7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	BOL3	P39724	118 aa		7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	FMP52	P40008	231 aa		7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	TPC1	P53257	314 aa		7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	INP1	Q03694	420 aa		7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YPR1	Q12458	312 aa		7.59	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	AI4	P03878	556 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	SNC1	P31109	117 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MDL1	P33310	695 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ECT1	P33412	323 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	CLG1	P35190	452 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MCM7	P38132	845 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.58	□□□□□ -1.2	not detected
GGA2	YHR108W	SDP1	P40479	209 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	LEM3	P42838	414 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	APS3	P47064	194 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YJR098C	P47139	656 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ERV29	P53337	310 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	NUP116	Q02630	1113 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	SNO4	Q04902	237 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HSP32	Q08992	237 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YDL177C	Q12257	170 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	GAL4	P04386	881 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ERD2	P18414	219 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HYM1	P32464	399 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YEF1	P32622	495 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	PAU24	P38155	120 aa		7.57	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	ANS1	P38832	159 aa		7.57	□□□□□ -1.2

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