RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	BAG3	O95817	575 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SCG2	P13521	617 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	HOXC13	P31276	330 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	AFM	P43652	599 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	PTGDR	Q13258	359 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	GIT2	Q14161	759 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC32	Q14392	662 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	WTAP	Q15007	396 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	DGKD	Q16760	1214 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA5	Q8NB90	893 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SCFD2	Q8WU76	684 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	NUP205	Q92621	2012 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM149A	A5PLN7	773 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	CHRNB1	P11230	501 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	DRD2	P14416	443 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	GBP1	P32455	592 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SHMT1	P34896	483 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	PHKA1	P46020	1223 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	ICA1	Q05084	483 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	C2orf27A	Q580R0	203 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	RASEF	Q8IZ41	740 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF558	Q96NG5	402 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	PIDD1	Q9HB75	910 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	NBAS	A2RRP1	2371 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	HAS3	O00219	553 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	PLK4	O00444	970 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	INPPL1	O15357	1258 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SH3BP5	O60239	455 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	F2	P00734	622 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF286B	P0CG31	522 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	LINS1	Q8NG48	757 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	DNASE1L2	Q92874	299 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	HIC2	Q96JB3	615 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	LGMN	Q99538	433 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	KXD1	Q9BQD3	176 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SGPP1	Q9BX95	441 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	STK31	Q9BXU1	1019 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	CWH43	Q9H720	699 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	SPG21	Q9NZD8	308 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	PCSK5	Q92824	1860 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNAP23-223	ENST00000627440	ZMYM6	O95789	1325 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440		A1L4Q6	167 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP9A	O75110	1047 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	CD59	P13987	128 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	PBX3	P40426	434 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	RIPK4	P57078	832 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXK1	P85037	733 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	RASGRF1	Q13972	1273 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	LPIN1	Q14693	890 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	DCAF6	Q58WW2	860 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZS52	159 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	PIGK	Q92643	395 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	GOPC	Q9HD26	462 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	STARD5	Q9NSY2	213 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF146	Q9NTX7	359 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	RAI14	Q9P0K7	980 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	AK5	Q9Y6K8	562 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	STAB1	Q9NY15	2570 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	GH1	P01241	217 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2

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