RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596545.5

FARP1-218, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene FARP1, Length 781 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1-218ENST00000596545 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 LPIN1Q14693 890 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 EMC2Q15006 297 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ECM1Q16610 540 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 KIZQ2M2Z5 673 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CABP7Q86V35 215 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 SEPT8Q92599 483 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CSRNP2Q9H175 543 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 STK17AQ9UEE5 414 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 USP25Q9UHP3 1055 aa14.77□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 BAIAP3O94812 1187 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 RASIP1Q5U651 963 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 SCLT1Q96NL6 688 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 OSMRQ99650 979 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 MTRQ99707 1265 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 SQORQ9Y6N5 450 aa14.76□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ASAP2O43150 1006 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 GPR32O75388 356 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 EYA4O95677 639 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 GPC3P51654 580 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 POU5F1BQ06416 359 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 IKBKEQ14164 716 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 TCTN1Q2MV58 587 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 IQUBQ8NA54 791 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 USP38Q8NB14 1042 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 TCP11Q8WWU5 503 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 APBB2Q92870 758 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 TMEM143Q96AN5 459 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.75□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 E9PMD0 336 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CD52P31358 61 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 KCNJ6P48051 423 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 PAK2Q13177 524 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 RESP18Q5W5W9 173 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 NLRP7Q8WX94 980 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 NLRP4Q96MN2 994 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CLIC6Q96NY7 704 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 PNMA5Q96PV4 448 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 PLIN2Q99541 437 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.74□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 EFCAB14O75071 495 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 RPS6KA5O75582 802 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 MYL1P05976 194 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CYP11B2P19099 503 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ABCD1P33897 745 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 GRB10Q13322 594 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 SPECC1Q5M775 1068 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 PADI6Q6TGC4 694 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 KCNK18Q7Z418 384 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ZNF410Q86VK4 478 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 KSR1Q8IVT5 923 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 KCNN1Q92952 543 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 GBP4Q96PP9 640 aa14.73□□□□□ -0.05
FARP1-218ENST00000596545 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 252.2 ms