RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF3CO14782 793 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TCEA3O75764 348 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 GZMAP12544 262 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCD1P33897 745 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PPATQ06203 517 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 GABPAQ06546 454 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CALCOCO2Q13137 446 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF22Q14807 665 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP1B1Q16678 543 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 USP37Q86T82 979 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC63Q8NA47 563 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35C1Q96A29 364 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC77Q9BR77 488 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TIPINQ9BVW5 301 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPHQ9H3R5 247 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 GCNT4Q9P109 453 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TRPC6Q9Y210 931 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 STRCQ7RTU9 1775 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 AFF2P51816 1311 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ESYT3A0FGR9 886 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 DAPK3O43293 454 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PPIP5K2O43314 1243 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 BBOX1O75936 387 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 FGGP02679 453 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MMEP08473 750 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP3A4P08684 503 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFAIP3P21580 790 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CCND1P24385 295 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SREBF1P36956 1147 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 RASSF2P50749 326 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC18A1P54219 525 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 GIT2Q14161 759 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PLS1Q14651 629 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CERKQ8TCT0 537 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MKL1Q969V6 931 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM11Q96F44 468 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 EHD2Q9NZN4 543 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SENP1Q9P0U3 644 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 WHRNQ9P202 907 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SLX4Q8IY92 1834 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L5A8MUK1 530 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PIK3CDO00329 1044 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.072e-10■□□□□ 10.5
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTS3O15072 1205 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TTI1O43156 1089 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 EVI5O60447 810 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT13P13646 458 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ALADP13716 330 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ITIH2P19823 946 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SCP2P22307 547 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CTNNA2P26232 953 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC24CP53992 1094 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 GALCP54803 685 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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