RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523985.5

CCNC-217, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCNC, Length 958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-217ENST00000523985 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 TMEM150BA6NC51 233 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 GRXCR1A8MXD5 290 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 RESTQ13127 1097 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 TFDP1Q14186 410 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 EMC2Q15006 297 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 TCTN1Q2MV58 587 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 HYIQ5T013 277 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 ATL3Q6DD88 541 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 MYOCDQ8IZQ8 938 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 SCLT1Q96NL6 688 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 OSMRQ99650 979 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 RGS18Q9NS28 235 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.1■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 DENND3A2RUS2 1198 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 ZBTB39O15060 712 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 DEFB103AP81534 67 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 FERMT3Q86UX7 667 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 SAMD11Q96NU1 681 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 DACT1Q9NYF0 836 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.09■□□□□ 0.17
CCNC-217ENST00000523985 ARHGEF35A5YM69 484 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 SLC34A2O95436 690 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 EYA4O95677 639 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 SKIP12755 728 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 CYP11B2P19099 503 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 ARL2P36404 184 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 PBX2P40425 430 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 UBA7P41226 1012 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 SARSP49591 514 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 RABGGTBP53611 331 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 FAM189BP81408 668 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 IL17AQ16552 155 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 FAM228AQ86W67 206 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 TMEM40Q8WWA1 233 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 TIPINQ9BVW5 301 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 KCND2Q9NZV8 630 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 LAMA3Q16787 3333 aa16.08■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 A0A087WZ62 844 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 AXLP30530 894 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 PHKA2P46019 1235 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 DRP2Q13474 957 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 DSC3Q14574 896 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 SLC39A14Q15043 492 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 POTEGQ6S5H5 508 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 PADI6Q6TGC4 694 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 CRIPAKQ8N1N5 446 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 TMEM143Q96AN5 459 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 CALML4Q96GE6 196 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 YME1L1Q96TA2 773 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 ADAM2Q99965 735 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 TMX1Q9H3N1 280 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 IFT122Q9HBG6 1241 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 HOXA2O43364 376 aa16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 EOMESO95936 686 aa16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 CA3P07451 260 aa16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 PTENP60484 403 aa16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 PPP2R5AQ15172 486 aa16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 PTPAQ15257 358 aa16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 KIFAP3Q92845 792 aa16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.06■□□□□ 0.16
CCNC-217ENST00000523985 LRFN2Q9ULH4 789 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms