RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 PSMD10O75832 226 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 FGF18O76093 207 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 GPC3P51654 580 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 ODR4Q5SWX8 454 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 EFHBQ8N7U6 833 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.24□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 MAP7D2Q96T17 732 aa14.24□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.24□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.24□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 Q4G0T1 1027 aa14.23□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.23□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 BLIDQ8IZY5 108 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 RNF169Q8NCN4 708 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 TLE6Q9H808 572 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 TLR9Q9NR96 1032 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.23□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 SLC37A4O43826 429 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 DEXIO95424 95 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 TMOD1P28289 359 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 JAK3P52333 1124 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 RNF135Q8IUD6 432 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 NLRP7Q8WX94 980 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 SCLT1Q96NL6 688 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 CYP3A7P24462 503 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 UBE3AQ05086 875 aa14.21□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 INF2Q27J81 1249 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 LONRF3Q496Y0 759 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 APOL5Q9BWW9 433 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-212ENST00000485532 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.21□□□□□ -0.13
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PRAME-212ENST00000485532 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 HIDE1A8MVS5 230 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 EML1O00423 815 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 LAG3P18627 525 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 COASYQ13057 564 aa14.2□□□□□ -0.14
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PRAME-212ENST00000485532 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.2□□□□□ -0.14
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PRAME-212ENST00000485532 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 KSR1Q8IVT5 923 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 HELQQ8TDG4 1101 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 MBOAT7Q96N66 472 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 SCRN1Q12765 414 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-212ENST00000485532 LETM2Q2VYF4 491 aa14.19□□□□□ -0.14
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