RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFRA1P56159 465 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEKQ02763 1124 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCRN1Q12765 414 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTP2Q5QGT7 225 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSMFQ6X4W1 530 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 APPBP2Q92624 585 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 COPS5Q92905 334 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSBP2Q969R2 916 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 MISP3Q96FF7 219 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEIS3Q99687 375 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 VEZTQ9HBM0 779 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD209Q9NNX6 404 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP26B1Q9NR63 512 aa5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 WNT10BO00744 389 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKTNO75072 461 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCG5P05408 212 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSTM1P09488 218 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD8BP10966 210 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPINK2P20155 84 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD3B2P26439 372 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXC12P31275 282 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOP2P46087 812 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 EGR3Q06889 387 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALDH1L2Q3SY69 923 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZPBP2Q6X784 338 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFXL1Q6ZNB6 911 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRED2Q7Z698 418 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 DTX1Q86Y01 620 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOMER1Q86YM7 354 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf159Q96HA4 380 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC6Q99741 560 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC39Q9UFE4 941 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC285556D6RIA3 1793 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 UTYO14607 1347 aa5.47□□□□□ -1.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM82A0PJX8 343 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC45O75419 566 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCAR3O75815 825 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASMTLO95671 621 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRNPP04156 253 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM27P14373 513 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECI1P42126 302 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ6P48051 423 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 RARSP54136 660 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNB3P54284 484 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 IKZF1Q13422 519 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLGAP5Q15398 846 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 TKFCQ3LXA3 575 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP100Q494V2 611 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf69Q8N8R5 385 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 KREMEN2Q8NCW0 462 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP44Q9H0E7 712 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGAP2Q9UHJ9 254 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms