RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 CUL4BQ13620 913 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 GIT2Q14161 759 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 FAM102BQ5T8I3 360 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 FAM126BQ8IXS8 530 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01465Q8N7H1 131 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 C7orf25Q9BPX7 421 aa32.77■■■□□ 2.84
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ECHS1-201ENST00000368547 MYH11P35749 1972 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
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ECHS1-201ENST00000368547 PRR29P0C7W0 189 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 POSTNQ15063 836 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 SERINC5Q86VE9 423 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC19Q96DA6 116 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 TIPINQ9BVW5 301 aa32.77■■■□□ 2.84
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa32.76■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 TMOD1P28289 359 aa32.76■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 DNM2P50570 870 aa32.76■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC26Q2I0M4 334 aa32.76■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM60Q495X7 471 aa32.76■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 RSPH10B2B2RC85 870 aa32.75■■■□□ 2.83
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ECHS1-201ENST00000368547 RSPH10BP0C881 870 aa32.75■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa32.75■■■□□ 2.83
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ECHS1-201ENST00000368547 TCP11Q8WWU5 503 aa32.75■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 ODF2LQ9ULJ1 636 aa32.75■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 MYL1P05976 194 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 ASIC1P78348 528 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 MAPK7Q13164 816 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 PNOCQ13519 176 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 IER5Q5VY09 327 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 TAF2Q6P1X5 1199 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 CNNM4Q6P4Q7 775 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 SASS6Q6UVJ0 657 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1468Q9P260 1216 aa32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 SFI1A8K8P3 1242 aa32.73■■■□□ 2.83
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ECHS1-201ENST00000368547 DRC1Q96MC2 740 aa32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa32.73■■■□□ 2.83
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ECHS1-201ENST00000368547 IDEP14735 1019 aa32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 ARL2P36404 184 aa32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 MRE11P49959 708 aa32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 RTP1P59025 263 aa32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 TLE2Q04725 743 aa32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 PTK7Q13308 1070 aa32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 WNT8BQ93098 351 aa32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 MAP7D2Q96T17 732 aa32.73■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 AKT3Q9Y243 479 aa32.73■■■□□ 2.83
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ECHS1-201ENST00000368547 DPYDQ12882 1025 aa32.72■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
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ECHS1-201ENST00000368547 TOX2Q96NM4 488 aa32.72■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 ZHX3Q9H4I2 956 aa32.72■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 DCDC2CA8MYV0 355 aa32.71■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 FAM13AO94988 1023 aa32.71■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 VTNP04004 478 aa32.71■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 RHPN2Q8IUC4 686 aa32.7■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 GRPEL1Q9HAV7 217 aa32.7■■■□□ 2.83
ECHS1-201ENST00000368547 CAVIN2O95810 425 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 KSR1Q8IVT5 923 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 ASAP3Q8TDY4 903 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 BSNDQ8WZ55 320 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 PANK4Q9NVE7 773 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 GLRA2P23416 452 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF131P52739 623 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM62Q0P6H9 643 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 FAAP100Q0VG06 881 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
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ECHS1-201ENST00000368547 PARVGQ9HBI0 331 aa32.69■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 FRMD3A2A2Y4 597 aa32.68■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 UNC13DQ70J99 1090 aa32.68■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 RSPH3Q86UC2 560 aa32.68■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 NME8Q8N427 588 aa32.68■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 MYCT1Q8N699 235 aa32.68■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R16BQ96T49 567 aa32.68■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa32.68■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 ALPK3Q96L96 1907 aa32.68■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 KLRC4O43908 158 aa32.67■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 RPN1P04843 607 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 RPAINQ86UA6 219 aa32.67■■■□□ 2.82
ECHS1-201ENST00000368547 IFT74Q96LB3 600 aa32.67■■■□□ 2.82
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