RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 HnrnprQ8VHM5 632 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CoasyQ9DBL7 563 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hmgxb3G3X9M3 1254 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sycp3P70281 254 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sap30bpQ02614 308 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Spc25Q3UA16 226 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tab3Q571K4 716 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pcdhb14Q6PB90 796 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Apol9bQ8C7I4 310 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 GlyctkQ8QZY2 523 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gga1Q8R0H9 635 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Apol9aQ8VDU3 310 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eme2Q56A04 373 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 QarsQ8BML9 775 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rpa1Q8VEE4 623 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gpaa1Q9WTK3 621 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tlr7P58681 1050 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CapslQ6P8Y1 208 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ddx47Q9CWX9 455 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa14.8□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cd3dP04235 173 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ckap2Q3V1H1 664 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 DeptorQ570Y9 409 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atl2Q6PA06 583 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Morc2bQ8C5W4 1022 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cyp2ab1S4R196 498 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mroh8E9PYI4 1049 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rad51bO35719 350 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmprss15P97435 1069 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 GypcQ78HU7 95 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ppp2r5dQ91V89 594 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hdac11Q91WA3 347 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Jph2Q9ET78 696 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Deaf1Q9Z1T5 566 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kcnb2A6H8H5 907 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mms22lB1AUR6 1238 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 FosP01101 380 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 YwhahP68510 246 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mcl1P97287 331 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Agap2Q3UHD9 1186 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr118Q7TRJ6 321 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fam192aQ91WE2 254 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ciao1Q99KN2 339 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Bcl9Q9D219 1425 aa14.79□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mapkapk5O54992 473 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Klhdc10Q6PAR0 439 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tcp10aQ80W76 438 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Srrm3Q80WV7 648 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rmnd1Q8CI78 450 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Clptm1Q8VBZ3 664 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kctd10Q922M3 315 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Phf2Q9WTU0 1096 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prl3b1P09586 222 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mup5P11591 180 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dynlt1P51807 113 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Llgl2Q3TJ91 1027 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Asap2Q7SIG6 958 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ahcyl1Q80SW1 530 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kcns3Q8BQZ8 491 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gps1Q99LD4 471 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zswim7Q9CWQ2 152 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ehd4Q9EQP2 541 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rcan1Q9JHG6 198 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm5926E9PWJ8 236 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cyp3a25O09158 503 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eif6O55135 245 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Grin1P35438 938 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 TxkP42682 527 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tex11Q14AT2 947 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm4981Q3ULJ8 291 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mkrn3Q60764 544 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Baiap3Q80TT2 1134 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem134Q8R0J4 195 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr866Q8VFI7 312 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pcdhb12Q91Y07 789 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 GzmnQ920S1 248 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Traf7Q922B6 594 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nek3Q9R0A5 511 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lrrc4bP0C192 709 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt86P97861 486 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pla2g4eQ50L42 875 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 RgmbQ7TQ33 436 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ankrd45Q810N6 248 aa14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa14.77□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rexo5D3YW29 759 aa14.77□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt10P02535 570 aa14.77□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sash1P59808 1230 aa14.77□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eya3P97480 510 aa14.77□□□□□ -0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lrig2Q52KR2 1054 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.6 ms