Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI78

Rmnd1, Required for meiotic nuclear division protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmnd1Q8CI78 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rmnd1Q8CI78 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Rmnd1Q8CI78 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rmnd1Q8CI78 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rmnd1Q8CI78 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rmnd1Q8CI78 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rmnd1Q8CI78 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rmnd1Q8CI78 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rmnd1Q8CI78 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rmnd1Q8CI78 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rmnd1Q8CI78 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rmnd1Q8CI78 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rmnd1Q8CI78 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rmnd1Q8CI78 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Rmnd1Q8CI78 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rmnd1Q8CI78 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rmnd1Q8CI78 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rmnd1Q8CI78 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rmnd1Q8CI78 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rmnd1Q8CI78 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rmnd1Q8CI78 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rmnd1Q8CI78 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rmnd1Q8CI78 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rmnd1Q8CI78 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rmnd1Q8CI78 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rmnd1Q8CI78 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rmnd1Q8CI78 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rmnd1Q8CI78 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rmnd1Q8CI78 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rmnd1Q8CI78 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rmnd1Q8CI78 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rmnd1Q8CI78 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rmnd1Q8CI78 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rmnd1Q8CI78 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rmnd1Q8CI78 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rmnd1Q8CI78 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rmnd1Q8CI78 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rmnd1Q8CI78 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rmnd1Q8CI78 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rmnd1Q8CI78 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rmnd1Q8CI78 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rmnd1Q8CI78 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rmnd1Q8CI78 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rmnd1Q8CI78 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rmnd1Q8CI78 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rmnd1Q8CI78 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rmnd1Q8CI78 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rmnd1Q8CI78 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rmnd1Q8CI78 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rmnd1Q8CI78 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rmnd1Q8CI78 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rmnd1Q8CI78 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rmnd1Q8CI78 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rmnd1Q8CI78 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rmnd1Q8CI78 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rmnd1Q8CI78 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rmnd1Q8CI78 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rmnd1Q8CI78 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rmnd1Q8CI78 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rmnd1Q8CI78 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rmnd1Q8CI78 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rmnd1Q8CI78 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rmnd1Q8CI78 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rmnd1Q8CI78 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rmnd1Q8CI78 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rmnd1Q8CI78 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rmnd1Q8CI78 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rmnd1Q8CI78 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rmnd1Q8CI78 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rmnd1Q8CI78 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rmnd1Q8CI78 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rmnd1Q8CI78 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rmnd1Q8CI78 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rmnd1Q8CI78 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rmnd1Q8CI78 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rmnd1Q8CI78 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rmnd1Q8CI78 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rmnd1Q8CI78 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rmnd1Q8CI78 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rmnd1Q8CI78 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rmnd1Q8CI78 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rmnd1Q8CI78 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rmnd1Q8CI78 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rmnd1Q8CI78 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rmnd1Q8CI78 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rmnd1Q8CI78 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rmnd1Q8CI78 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rmnd1Q8CI78 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rmnd1Q8CI78 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rmnd1Q8CI78 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rmnd1Q8CI78 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rmnd1Q8CI78 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rmnd1Q8CI78 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rmnd1Q8CI78 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rmnd1Q8CI78 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rmnd1Q8CI78 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rmnd1Q8CI78 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rmnd1Q8CI78 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rmnd1Q8CI78 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rmnd1Q8CI78 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms