RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	MRX6	P48564	524 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YDL183C	P48569	320 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AZR1	P50080	613 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	NBP35	P52920	328 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TOF2	Q02208	771 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MSC1	Q03104	513 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SNO1	Q03144	224 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TRS31	Q03337	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RIF2	Q06208	395 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RAD28	Q12021	506 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YOP1	Q12402	180 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PCD1	Q12524	340 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ECM29	P38737	1868 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PRC1	P00729	532 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SEC12	P11655	471 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CKA1	P15790	372 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YCR102C	P25608	368 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PHO91	P27514	894 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	URA10	P30402	227 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
SKG6	YHR149C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SRO77	P38163	1010 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	STS1	P38637	319 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PEX28	P38848	579 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PCL7	P40186	285 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	POG1	P40473	351 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
SKG6	YHR149C	PRM10	P42946	383 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	NIT2	P47016	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TAX4	P47030	604 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	LOH1	P47055	219 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ARH1	P48360	493 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YGL159W	P53110	370 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YGR127W	P53275	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ERV29	P53337	310 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MKC7	P53379	596 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
SKG6	YHR149C	RKM2	Q03942	479 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	THI7	Q05998	598 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ECM7	Q06200	448 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MED7	Q08278	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	FDH1	Q08911	376 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MHT1	Q12525	324 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SUC2	P00724	532 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
SKG6	YHR149C	COQ3	P27680	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	BCS1	P32839	456 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SDH3	P33421	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	COG3	P40094	801 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	KHA1	P40309	873 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MND2	P40577	368 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ATG18	P43601	500 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CHA4	P43634	648 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TAD2	P47058	250 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ROG1	P53118	685 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YGR017W	P53210	297 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TNA1	P53322	534 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	DST1	P07273	309 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ERD1	P16151	362 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PER1	P25625	357 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ADE1	P27616	306 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SYN8	P31377	255 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RRN10	P38204	145 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	HSL7	P38274	827 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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