RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC160A6NGH7 325 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 EPHA7Q15375 998 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 MCF2LO15068 1137 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ERICH1Q86X53 443 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNYQ8ND76 341 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF302Q9NR11 478 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCB6Q9NP58 842 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 RWDD2BP57060 319 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 VAMP7P51809 220 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 TROAPQ12815 778 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 LPXNO60711 386 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 STXBP3O00186 592 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 EYA4O95677 639 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 INHBAP08476 426 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM49P0CI25 452 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM49CP0CI26 452 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 MTMR2Q13614 643 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 MICALL2Q8IY33 904 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CASP8Q14790 479 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 METTL23Q86XA0 190 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PQC6 194 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 SAT1P21673 171 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 DR1Q01658 176 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 SAAL1Q96ER3 474 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL4AP40617 200 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ADCY1Q08828 1119 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 KCTD6Q8NC69 237 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CDKL2Q92772 493 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 MTRQ99707 1265 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 PRPSAP2O60256 369 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 FMO2Q99518 471 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRJ-208ENST00000615445 OATP04181 439 aa22.26■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM270Q6UE05 265 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ANO9A1A5B4 782 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 HIP1RO75146 1068 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ADSSL1Q8N142 457 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SCINQ9Y6U3 715 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SLCO1A2P46721 670 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 NFU1Q9UMS0 254 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC188H7C350 402 aa22.26■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 ITSN1Q15811 1721 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTN1P12814 892 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 RASSF2P50749 326 aa22.25■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 STK4Q13043 487 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 MTF1Q14872 753 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 PASD1Q8IV76 773 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 WHAMMQ8TF30 809 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 CCT5P48643 541 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 GPC5P78333 572 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.25■■□□□ 1.15
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