RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 NFU1Q9UMS0 254 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SATB2Q9UPW6 733 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A0U1RQJ8 604 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 POTEFA5A3E0 1075 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 E7EWF7 191 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SEMA3EO15041 775 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP3K13O43283 966 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 LGR5O75473 907 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TJP3O95049 919 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT16P08779 473 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PDGFRBP09619 1106 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CCT8P50990 548 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PARP10Q53GL7 1025 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GLTPD2A6NH11 291 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TTI1O43156 1089 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE5AO76074 875 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 NFKBIAP25963 317 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SPAG1Q07617 926 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CGREF1Q99674 301 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 STK24Q9Y6E0 443 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MYPNQ86TC9 1320 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP9AO75110 1047 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 RARAP10276 462 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 FUT4P22083 530 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TUBA4AP68366 448 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 LIN52Q52LA3 116 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CROCCP2Q86T23 111 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 NACC2Q96BF6 587 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GREM2Q9H772 168 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 EURLQ9NYK6 297 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SNX12Q9UMY4 172 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MAST3O60307 1309 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 RXRAP19793 462 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 RASSF2P50749 326 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 RAB15P59190 212 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PNOCQ13519 176 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PARP6Q2NL67 630 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 DAAM2Q86T65 1068 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA24Q86W54 205 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 VPS37DQ86XT2 251 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GDAP1Q8TB36 358 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 OSBP2Q969R2 916 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TSKSQ9UJT2 592 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MED23Q9ULK4 1368 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF609O15014 1411 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 O00370 1275 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GPAA1O43292 621 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CBFA2T3O75081 653 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 LCA5LO95447 670 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GNA14O95837 355 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CPA3P15088 417 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TUBA1BP68363 451 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GRM1Q13255 1194 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ITGA9Q13797 1035 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 LONRF3Q496Y0 759 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SMUG1Q53HV7 270 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TUBA1AQ71U36 451 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 NCOA7Q8NI08 942 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.2 ms