RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 MYRIPQ8NFW9 859 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ORAI2Q96SN7 254 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 JAM3Q9BX67 310 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NLRP1Q9C000 1473 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TOMM22Q9NS69 142 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 STK26Q9P289 416 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 DIP2AQ14689 1571 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CD163L1Q9NR16 1453 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TECPR2O15040 1411 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF521Q96K83 1311 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNK3O14649 394 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TBX3O15119 743 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO1BO43795 1136 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 OFD1O75665 1012 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 RHCEP18577 417 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT15P19012 456 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL6P41182 706 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC10P48553 1259 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 IRF9Q00978 393 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 RHDQ02161 417 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF174Q15697 407 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 GAB4Q2WGN9 574 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PAOXQ6QHF9 649 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZAR1Q86SH2 424 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 MFSD4AQ8N468 514 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PTCHD1Q96NR3 888 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAM1Q96QH2 718 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NACC1Q96RE7 527 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF38Q9H0F5 515 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
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CAPNS1-210ENST00000590211 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf72A4D263 438 aa5.08□□□□□ -1.6
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CAPNS1-210ENST00000590211 TPP1O14773 563 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SYPP08247 313 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 MYL3P08590 195 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 MYBP10242 640 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC5A1P13866 664 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 OXCT1P55809 520 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 POU5F1BQ06416 359 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR19Q15760 415 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SKAP1Q86WV1 359 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 HPS3Q969F9 1004 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM169Q96HH4 297 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMAT4Q9H898 229 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CASS4Q9NQ75 786 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDND1Q9NY35 253 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 NRKQ7Z2Y5 1582 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM2Q9UHN6 1383 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM82A0PJX8 343 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 HMX2A2RU54 273 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 KDM1AO60341 852 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBED1O96006 694 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 POU2F2P09086 479 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 COL6A2P12110 1019 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 C5AR1P21730 350 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 GTF2A2P52657 109 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF11P52732 1056 aa5.07□□□□□ -1.6
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