RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	VTN	P04004	478 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP4A	P20648	1035 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	CLCN3	P51790	818 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TAP1	Q03518	808 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	C4orf19	Q8IY42	314 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ABI1	Q8IZP0	508 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	OSMR	Q99650	979 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF2C	Q99661	725 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LXN	Q9BS40	222 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	AAAS	Q9NRG9	546 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	GBF1	Q92538	1859 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ASAP2	O43150	1006 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF862	O60290	1169 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SKI	P12755	728 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	PDC	P20941	246 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	UGCG	Q16739	394 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	AAK1	Q2M2I8	961 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	XKR9	Q5GH70	373 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC38	Q5R3I4	469 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF410	Q86VK4	478 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFRSF25	Q93038	417 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TMX3	Q96JJ7	454 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	VAV3	Q9UKW4	847 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	EVPL	Q92817	2033 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LAD1	O00515	517 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	EDIL3	O43854	480 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	DTNB	O60941	627 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	RB1	P06400	928 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVK-21	P61565	698 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP4A11	Q02928	519 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TFDP1	Q14186	410 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	HAS1	Q92839	578 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	DYDC2	Q96IM9	177 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	MTR	Q99707	1265 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAM2	Q99965	735 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01553	A4QN01	128 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	EML1	O00423	815 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	DGAT1	O75907	488 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	GJB2	P29033	226 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	CTNNB1	P35222	781 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TEC	P42680	631 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	GPC3	P51654	580 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF174	Q15697	407 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	NLRP4	Q96MN2	994 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	CHST12	Q9NRB3	414 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	RGS18	Q9NS28	235 aa		12.65	□□□□□ -0.38

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